Protein–RNA interactions for Protein: Q15008

PSMD6, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD6Q15008 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSMD6Q15008 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PSMD6Q15008 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSMD6Q15008 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
PSMD6Q15008 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PSMD6Q15008 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PSMD6Q15008 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PSMD6Q15008 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PSMD6Q15008 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PSMD6Q15008 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PSMD6Q15008 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PSMD6Q15008 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PSMD6Q15008 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PSMD6Q15008 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PSMD6Q15008 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PSMD6Q15008 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PSMD6Q15008 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PSMD6Q15008 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PSMD6Q15008 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PSMD6Q15008 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PSMD6Q15008 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PSMD6Q15008 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSMD6Q15008 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSMD6Q15008 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSMD6Q15008 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSMD6Q15008 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSMD6Q15008 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSMD6Q15008 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSMD6Q15008 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSMD6Q15008 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSMD6Q15008 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PSMD6Q15008 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSMD6Q15008 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSMD6Q15008 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSMD6Q15008 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PSMD6Q15008 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSMD6Q15008 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSMD6Q15008 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSMD6Q15008 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSMD6Q15008 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PSMD6Q15008 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PSMD6Q15008 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PSMD6Q15008 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PSMD6Q15008 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PSMD6Q15008 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PSMD6Q15008 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PSMD6Q15008 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PSMD6Q15008 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PSMD6Q15008 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PSMD6Q15008 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSMD6Q15008 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSMD6Q15008 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSMD6Q15008 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSMD6Q15008 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSMD6Q15008 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSMD6Q15008 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSMD6Q15008 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSMD6Q15008 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSMD6Q15008 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSMD6Q15008 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSMD6Q15008 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSMD6Q15008 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSMD6Q15008 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSMD6Q15008 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSMD6Q15008 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSMD6Q15008 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSMD6Q15008 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSMD6Q15008 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSMD6Q15008 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSMD6Q15008 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSMD6Q15008 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSMD6Q15008 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSMD6Q15008 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PSMD6Q15008 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSMD6Q15008 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSMD6Q15008 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSMD6Q15008 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSMD6Q15008 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PSMD6Q15008 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PSMD6Q15008 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PSMD6Q15008 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PSMD6Q15008 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PSMD6Q15008 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PSMD6Q15008 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PSMD6Q15008 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PSMD6Q15008 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PSMD6Q15008 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PSMD6Q15008 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PSMD6Q15008 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PSMD6Q15008 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PSMD6Q15008 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PSMD6Q15008 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PSMD6Q15008 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PSMD6Q15008 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PSMD6Q15008 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PSMD6Q15008 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PSMD6Q15008 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PSMD6Q15008 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PSMD6Q15008 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PSMD6Q15008 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
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