Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NME3Q13232 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NME3Q13232 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NME3Q13232 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NME3Q13232 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NME3Q13232 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NME3Q13232 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NME3Q13232 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NME3Q13232 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NME3Q13232 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NME3Q13232 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
NME3Q13232 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NME3Q13232 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NME3Q13232 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NME3Q13232 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NME3Q13232 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NME3Q13232 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NME3Q13232 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NME3Q13232 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NME3Q13232 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NME3Q13232 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NME3Q13232 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NME3Q13232 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NME3Q13232 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NME3Q13232 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NME3Q13232 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NME3Q13232 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NME3Q13232 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NME3Q13232 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NME3Q13232 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NME3Q13232 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NME3Q13232 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NME3Q13232 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NME3Q13232 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NME3Q13232 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NME3Q13232 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NME3Q13232 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NME3Q13232 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NME3Q13232 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
NME3Q13232 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NME3Q13232 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NME3Q13232 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NME3Q13232 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NME3Q13232 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NME3Q13232 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NME3Q13232 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NME3Q13232 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NME3Q13232 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NME3Q13232 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
NME3Q13232 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NME3Q13232 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
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NME3Q13232 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NME3Q13232 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NME3Q13232 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NME3Q13232 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NME3Q13232 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
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NME3Q13232 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
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NME3Q13232 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
NME3Q13232 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NME3Q13232 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NME3Q13232 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NME3Q13232 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NME3Q13232 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NME3Q13232 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NME3Q13232 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NME3Q13232 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NME3Q13232 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
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NME3Q13232 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NME3Q13232 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
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NME3Q13232 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
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NME3Q13232 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
NME3Q13232 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NME3Q13232 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NME3Q13232 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NME3Q13232 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NME3Q13232 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NME3Q13232 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NME3Q13232 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
NME3Q13232 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NME3Q13232 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NME3Q13232 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NME3Q13232 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NME3Q13232 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NME3Q13232 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NME3Q13232 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NME3Q13232 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NME3Q13232 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NME3Q13232 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NME3Q13232 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NME3Q13232 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NME3Q13232 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NME3Q13232 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NME3Q13232 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
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