Protein–RNA interactions for Protein: Q13061

TRDN, Triadin, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDNQ13061 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRDNQ13061 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRDNQ13061 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRDNQ13061 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRDNQ13061 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRDNQ13061 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRDNQ13061 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRDNQ13061 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRDNQ13061 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRDNQ13061 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRDNQ13061 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRDNQ13061 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRDNQ13061 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRDNQ13061 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRDNQ13061 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRDNQ13061 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRDNQ13061 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
TRDNQ13061 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRDNQ13061 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRDNQ13061 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRDNQ13061 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRDNQ13061 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRDNQ13061 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRDNQ13061 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRDNQ13061 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRDNQ13061 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRDNQ13061 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRDNQ13061 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRDNQ13061 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TRDNQ13061 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TRDNQ13061 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TRDNQ13061 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TRDNQ13061 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
TRDNQ13061 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
TRDNQ13061 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TRDNQ13061 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRDNQ13061 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRDNQ13061 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRDNQ13061 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRDNQ13061 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRDNQ13061 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRDNQ13061 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRDNQ13061 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRDNQ13061 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRDNQ13061 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRDNQ13061 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRDNQ13061 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRDNQ13061 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRDNQ13061 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRDNQ13061 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
TRDNQ13061 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRDNQ13061 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRDNQ13061 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRDNQ13061 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRDNQ13061 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
TRDNQ13061 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRDNQ13061 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRDNQ13061 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRDNQ13061 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRDNQ13061 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRDNQ13061 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRDNQ13061 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
TRDNQ13061 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
TRDNQ13061 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRDNQ13061 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRDNQ13061 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRDNQ13061 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRDNQ13061 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRDNQ13061 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRDNQ13061 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRDNQ13061 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRDNQ13061 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRDNQ13061 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRDNQ13061 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRDNQ13061 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRDNQ13061 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRDNQ13061 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRDNQ13061 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRDNQ13061 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRDNQ13061 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRDNQ13061 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRDNQ13061 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRDNQ13061 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TRDNQ13061 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TRDNQ13061 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRDNQ13061 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRDNQ13061 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRDNQ13061 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRDNQ13061 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRDNQ13061 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRDNQ13061 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRDNQ13061 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRDNQ13061 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRDNQ13061 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRDNQ13061 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRDNQ13061 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TRDNQ13061 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRDNQ13061 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRDNQ13061 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TRDNQ13061 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
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