Protein–RNA interactions for Protein: Q12697

YPK9, Vacuolar cation-transporting ATPase YPK9, yeastyeast

Predictions only

Length 1,472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YPK9Q12697 YLR042CYLR042C 486 nt0.36□□□□□ -2.35
YPK9Q12697 SPC24YMR117C 642 nt0.36□□□□□ -2.35
YPK9Q12697 IZH4YOL101C 939 nt0.36□□□□□ -2.35
YPK9Q12697 SWF1YDR126W 1011 nt0.35□□□□□ -2.35
YPK9Q12697 YGR265WYGR265W 411 nt0.35□□□□□ -2.35
YPK9Q12697 YBR012CYBR012C 420 nt0.35□□□□□ -2.35
YPK9Q12697 snR45snR45 172 nt0.35□□□□□ -2.35
YPK9Q12697 MZM1YDR493W 372 nt0.35□□□□□ -2.35
YPK9Q12697 YJL156W-AYJL156W-A 222 nt0.35□□□□□ -2.35
YPK9Q12697 DDR48YMR173W 1293 nt0.35□□□□□ -2.35
YPK9Q12697 YOR105WYOR105W 327 nt0.35□□□□□ -2.35
YPK9Q12697 YOR169CYOR169C 465 nt0.35□□□□□ -2.35
YPK9Q12697 YDL196WYDL196W 330 nt0.34□□□□□ -2.36
YPK9Q12697 RAD6YGL058W 519 nt0.34□□□□□ -2.36
YPK9Q12697 RPL9BYNL067W 576 nt0.34□□□□□ -2.36
YPK9Q12697 YOR020W-AYOR020W-A 273 nt0.34□□□□□ -2.36
YPK9Q12697 PEP3YLR148W 2757 nt0.33□□□□□ -2.36
YPK9Q12697 YCR024C-BYCR024C-B 267 nt0.33□□□□□ -2.36
YPK9Q12697 BLS1YLR408C 369 nt0.33□□□□□ -2.36
YPK9Q12697 NGG1YDR176W 2109 nt0.33□□□□□ -2.36
YPK9Q12697 YLL007CYLL007C 1998 nt0.32□□□□□ -2.36
YPK9Q12697 ULI1YFR026C 510 nt0.32□□□□□ -2.36
YPK9Q12697 YKL183C-AYKL183C-A 213 nt0.32□□□□□ -2.36
YPK9Q12697 DPB11YJL090C 2295 nt0.32□□□□□ -2.36
YPK9Q12697 ECM12YHR021W-A 456 nt0.31□□□□□ -2.36
YPK9Q12697 BMT5YIL096C 1011 nt0.31□□□□□ -2.36
YPK9Q12697 YOR199WYOR199W 330 nt0.31□□□□□ -2.36
YPK9Q12697 YPL034WYPL034W 498 nt0.31□□□□□ -2.36
YPK9Q12697 YDR194W-AYDR194W-A 153 nt0.3□□□□□ -2.36
YPK9Q12697 YIL030W-AYIL030W-A 339 nt0.3□□□□□ -2.36
YPK9Q12697 NBP1YLR457C 960 nt0.3□□□□□ -2.36
YPK9Q12697 YMR324CYMR324C 243 nt0.3□□□□□ -2.36
YPK9Q12697 NUT2YPR168W 474 nt0.3□□□□□ -2.36
YPK9Q12697 GLG1YKR058W 1851 nt0.3□□□□□ -2.36
YPK9Q12697 CHZ1YER030W 462 nt0.29□□□□□ -2.36
YPK9Q12697 TOF2YKR010C 2316 nt0.29□□□□□ -2.36
YPK9Q12697 ABF2YMR072W 552 nt0.29□□□□□ -2.36
YPK9Q12697 PHO80YOL001W 882 nt0.29□□□□□ -2.36
YPK9Q12697 YGL109WYGL109W 324 nt0.29□□□□□ -2.36
YPK9Q12697 EDC1YGL222C 528 nt0.29□□□□□ -2.36
YPK9Q12697 IRC14YOR135C 342 nt0.29□□□□□ -2.36
YPK9Q12697 SLM6YBR266C 453 nt0.29□□□□□ -2.36
YPK9Q12697 UTP10YJL109C 5310 nt0.28□□□□□ -2.37
YPK9Q12697 YGL042CYGL042C 306 nt0.28□□□□□ -2.37
YPK9Q12697 TAD1YGL243W 1203 nt0.28□□□□□ -2.37
YPK9Q12697 YBR200W-AYBR200W-A 165 nt0.28□□□□□ -2.37
YPK9Q12697 YBR221W-AYBR221W-A 105 nt0.27□□□□□ -2.37
YPK9Q12697 SEC5YDR166C 2916 nt0.27□□□□□ -2.37
YPK9Q12697 YJL086CYJL086C 369 nt0.26□□□□□ -2.37
YPK9Q12697 YLR163W-AYLR163W-A 114 nt0.26□□□□□ -2.37
YPK9Q12697 RUF22RUF22 515 nt0.26□□□□□ -2.37
YPK9Q12697 MPT5YGL178W 2580 nt0.25□□□□□ -2.37
YPK9Q12697 RPS16AYMR143W 432 nt0.25□□□□□ -2.37
YPK9Q12697 PIG1YLR273C 1947 nt0.25□□□□□ -2.37
YPK9Q12697 NUP82YJL061W 2142 nt0.24□□□□□ -2.37
YPK9Q12697 YDR003W-AYDR003W-A 123 nt0.24□□□□□ -2.37
YPK9Q12697 RTR2YDR066C 591 nt0.24□□□□□ -2.37
YPK9Q12697 RSM27YGR215W 333 nt0.24□□□□□ -2.37
YPK9Q12697 BET4YJL031C 984 nt0.24□□□□□ -2.37
YPK9Q12697 GMC2YLR445W 567 nt0.24□□□□□ -2.37
YPK9Q12697 snR13snR13 124 nt0.24□□□□□ -2.37
YPK9Q12697 SLD3YGL113W 2007 nt0.24□□□□□ -2.37
YPK9Q12697 NNF2YGR089W 2811 nt0.23□□□□□ -2.37
YPK9Q12697 IMP3YHR148W 552 nt0.23□□□□□ -2.37
YPK9Q12697 YAR053WYAR053W 297 nt0.23□□□□□ -2.37
YPK9Q12697 RPL32YBL092W 393 nt0.23□□□□□ -2.37
YPK9Q12697 YDR034C-CYDR034C-C 1317 nt0.23□□□□□ -2.37
YPK9Q12697 YFL002W-BYFL002W-B 1317 nt0.23□□□□□ -2.37
YPK9Q12697 YGR161W-AYGR161W-A 1317 nt0.23□□□□□ -2.37
YPK9Q12697 YLR410W-AYLR410W-A 1317 nt0.23□□□□□ -2.37
YPK9Q12697 YBL100W-AYBL100W-A 1317 nt0.23□□□□□ -2.37
YPK9Q12697 YCL020WYCL020W 1317 nt0.23□□□□□ -2.37
YPK9Q12697 STO1YMR125W 2586 nt0.23□□□□□ -2.37
YPK9Q12697 YHR028W-AYHR028W-A 321 nt0.22□□□□□ -2.37
YPK9Q12697 RPL29YFR032C-A 180 nt0.22□□□□□ -2.37
YPK9Q12697 YDL206WYDL206W 2289 nt0.21□□□□□ -2.38
YPK9Q12697 MKT1YNL085W 2493 nt0.21□□□□□ -2.38
YPK9Q12697 YOR192C-AYOR192C-A 1317 nt0.21□□□□□ -2.38
YPK9Q12697 OCA6YDR067C 675 nt0.21□□□□□ -2.38
YPK9Q12697 NTF2YER009W 378 nt0.21□□□□□ -2.38
YPK9Q12697 YHL002C-AYHL002C-A 489 nt0.21□□□□□ -2.38
YPK9Q12697 CMS1YLR003C 876 nt0.21□□□□□ -2.38
YPK9Q12697 KAR3YPR141C 2190 nt0.2□□□□□ -2.38
YPK9Q12697 HDA3YPR179C 1968 nt0.2□□□□□ -2.38
YPK9Q12697 YDL068WYDL068W 330 nt0.19□□□□□ -2.38
YPK9Q12697 ALG13YGL047W 609 nt0.19□□□□□ -2.38
YPK9Q12697 THG1YGR024C 714 nt0.19□□□□□ -2.38
YPK9Q12697 SPC2YML055W 537 nt0.19□□□□□ -2.38
YPK9Q12697 PDE2YOR360C 1581 nt0.19□□□□□ -2.38
YPK9Q12697 NOC3YLR002C 1992 nt0.18□□□□□ -2.38
YPK9Q12697 PXA2YKL188C 2562 nt0.18□□□□□ -2.38
YPK9Q12697 SRP14YDL092W 441 nt0.18□□□□□ -2.38
YPK9Q12697 VPS74YDR372C 1038 nt0.18□□□□□ -2.38
YPK9Q12697 CRG1YHR209W 876 nt0.18□□□□□ -2.38
YPK9Q12697 BFR2YDR299W 1605 nt0.18□□□□□ -2.38
YPK9Q12697 ENV11YGR071C 2583 nt0.18□□□□□ -2.38
YPK9Q12697 RPL42BYHR141C 321 nt0.17□□□□□ -2.38
YPK9Q12697 RPL42AYNL162W 321 nt0.17□□□□□ -2.38
YPK9Q12697 SPR2YOR214C 711 nt0.17□□□□□ -2.38
YPK9Q12697 YDR509WYDR509W 348 nt0.16□□□□□ -2.38
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 95.9 ms