Protein–RNA interactions for Protein: Q12344

GYP5, GTPase-activating protein GYP5, yeastyeast

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
GYP5Q12344 PRP22YER013W 3438 nt3.99□□□□□ -1.77
GYP5Q12344 TAF1YGR274C 3201 nt3.99□□□□□ -1.77
GYP5Q12344 YIL080WYIL080W 4722 nt3.99□□□□□ -1.77
GYP5Q12344 tK(UUU)DtK(UUU)D 73 nt3.98□□□□□ -1.77
GYP5Q12344 tK(UUU)G1tK(UUU)G1 73 nt3.98□□□□□ -1.77
GYP5Q12344 tK(UUU)G2tK(UUU)G2 73 nt3.98□□□□□ -1.77
GYP5Q12344 tK(UUU)KtK(UUU)K 73 nt3.98□□□□□ -1.77
GYP5Q12344 tK(UUU)LtK(UUU)L 73 nt3.98□□□□□ -1.77
GYP5Q12344 tK(UUU)OtK(UUU)O 73 nt3.98□□□□□ -1.77
GYP5Q12344 tK(UUU)PtK(UUU)P 73 nt3.98□□□□□ -1.77
GYP5Q12344 snR53snR53 91 nt3.98□□□□□ -1.77
GYP5Q12344 PIP2YOR363C 2991 nt3.98□□□□□ -1.77
GYP5Q12344 MNE1YOR350C 1992 nt3.98□□□□□ -1.77
GYP5Q12344 RCY1YJL204C 2523 nt3.97□□□□□ -1.77
GYP5Q12344 tC(GCA)BtC(GCA)B 72 nt3.97□□□□□ -1.77
GYP5Q12344 tC(GCA)GtC(GCA)G 72 nt3.97□□□□□ -1.77
GYP5Q12344 tC(GCA)P1tC(GCA)P1 72 nt3.97□□□□□ -1.77
GYP5Q12344 tC(GCA)P2tC(GCA)P2 72 nt3.97□□□□□ -1.77
GYP5Q12344 RPS12YOR369C 432 nt3.97□□□□□ -1.77
GYP5Q12344 NPR3YHL023C 3441 nt3.97□□□□□ -1.77
GYP5Q12344 RPN2YIL075C 2838 nt3.96□□□□□ -1.78
GYP5Q12344 PRP5YBR237W 2550 nt3.96□□□□□ -1.78
GYP5Q12344 RPS30BYOR182C 192 nt3.96□□□□□ -1.78
GYP5Q12344 YPR108W-AYPR108W-A 213 nt3.96□□□□□ -1.78
GYP5Q12344 FYV10YIL097W 1551 nt3.96□□□□□ -1.78
GYP5Q12344 PSK2YOL045W 3306 nt3.96□□□□□ -1.78
GYP5Q12344 STE11YLR362W 2154 nt3.96□□□□□ -1.78
GYP5Q12344 TOP1YOL006C 2310 nt3.95□□□□□ -1.78
GYP5Q12344 YCR038W-AYCR038W-A 126 nt3.95□□□□□ -1.78
GYP5Q12344 UTP14YML093W 2700 nt3.94□□□□□ -1.78
GYP5Q12344 DAN4YJR151C 3486 nt3.94□□□□□ -1.78
GYP5Q12344 PDR8YLR266C 2106 nt3.94□□□□□ -1.78
GYP5Q12344 YNL114CYNL114C 372 nt3.94□□□□□ -1.78
GYP5Q12344 APL4YPR029C 2499 nt3.94□□□□□ -1.78
GYP5Q12344 SWI1YPL016W 3945 nt3.93□□□□□ -1.78
GYP5Q12344 ORC1YML065W 2745 nt3.93□□□□□ -1.78
GYP5Q12344 YDR034C-AYDR034C-A 177 nt3.93□□□□□ -1.78
GYP5Q12344 YNL018CYNL018C 1839 nt3.93□□□□□ -1.78
GYP5Q12344 DIA2YOR080W 2199 nt3.92□□□□□ -1.78
GYP5Q12344 KRE5YOR336W 4098 nt3.92□□□□□ -1.78
GYP5Q12344 SLM1YIL105C 2061 nt3.92□□□□□ -1.78
GYP5Q12344 YHR131W-AYHR131W-A 246 nt3.92□□□□□ -1.78
GYP5Q12344 YDR034C-DYDR034C-D 5313 nt3.92□□□□□ -1.78
GYP5Q12344 PUT3YKL015W 2940 nt3.92□□□□□ -1.78
GYP5Q12344 HSH155YMR288W 2916 nt3.92□□□□□ -1.78
GYP5Q12344 ITC1YGL133W 3795 nt3.92□□□□□ -1.78
GYP5Q12344 VBA4YDR119W 2307 nt3.92□□□□□ -1.78
GYP5Q12344 SPT16YGL207W 3108 nt3.91□□□□□ -1.78
GYP5Q12344 GSC2YGR032W 5688 nt3.91□□□□□ -1.78
GYP5Q12344 tV(CAC)DtV(CAC)D 73 nt3.9□□□□□ -1.79
GYP5Q12344 tV(CAC)HtV(CAC)H 73 nt3.9□□□□□ -1.79
GYP5Q12344 COX12YLR038C 252 nt3.9□□□□□ -1.79
GYP5Q12344 IRC8YJL051W 2469 nt3.9□□□□□ -1.79
GYP5Q12344 KAP95YLR347C 2586 nt3.9□□□□□ -1.79
GYP5Q12344 SBE22YHR103W 2559 nt3.89□□□□□ -1.79
GYP5Q12344 PTP3YER075C 2787 nt3.89□□□□□ -1.79
GYP5Q12344 COX5BYIL111W 456 nt3.89□□□□□ -1.79
GYP5Q12344 RPL42AYNL162W 321 nt3.89□□□□□ -1.79
GYP5Q12344 EMC1YCL045C 2283 nt3.89□□□□□ -1.79
GYP5Q12344 ATG11YPR049C 3537 nt3.89□□□□□ -1.79
GYP5Q12344 MDN1YLR106C 14733 nt3.89□□□□□ -1.79
GYP5Q12344 SNF5YBR289W 2718 nt3.88□□□□□ -1.79
GYP5Q12344 QCR9YGR183C 201 nt3.88□□□□□ -1.79
GYP5Q12344 YGR027W-BYGR027W-B 5268 nt3.88□□□□□ -1.79
GYP5Q12344 YLR227W-BYLR227W-B 5268 nt3.88□□□□□ -1.79
GYP5Q12344 YPR158C-DYPR158C-D 5268 nt3.88□□□□□ -1.79
GYP5Q12344 YGL140CYGL140C 3660 nt3.88□□□□□ -1.79
GYP5Q12344 YHR073W-AYHR073W-A 177 nt3.87□□□□□ -1.79
GYP5Q12344 REC8YPR007C 2043 nt3.87□□□□□ -1.79
GYP5Q12344 STE23YLR389C 3084 nt3.86□□□□□ -1.79
GYP5Q12344 RAD26YJR035W 3258 nt3.86□□□□□ -1.79
GYP5Q12344 VPS3YDR495C 3036 nt3.86□□□□□ -1.79
GYP5Q12344 FUN30YAL019W 3396 nt3.86□□□□□ -1.79
GYP5Q12344 YKU80YMR106C 1890 nt3.86□□□□□ -1.79
GYP5Q12344 RPA135YPR010C 3612 nt3.85□□□□□ -1.79
GYP5Q12344 BOI1YBL085W 2943 nt3.85□□□□□ -1.79
GYP5Q12344 FLO10YKR102W 3510 nt3.85□□□□□ -1.79
GYP5Q12344 UBP11YKR098C 2154 nt3.85□□□□□ -1.79
GYP5Q12344 PHM6YDR281C 315 nt3.85□□□□□ -1.79
GYP5Q12344 IRR1YIL026C 3453 nt3.85□□□□□ -1.79
GYP5Q12344 FLO5YHR211W 3228 nt3.84□□□□□ -1.79
GYP5Q12344 UBP14YBR058C 2346 nt3.84□□□□□ -1.79
GYP5Q12344 YDR210W-BYDR210W-B 5313 nt3.84□□□□□ -1.8
GYP5Q12344 YDR261W-BYDR261W-B 5313 nt3.84□□□□□ -1.8
GYP5Q12344 YFL002W-AYFL002W-A 5313 nt3.84□□□□□ -1.8
GYP5Q12344 YGR161W-BYGR161W-B 5313 nt3.84□□□□□ -1.8
GYP5Q12344 YLR410W-BYLR410W-B 5313 nt3.84□□□□□ -1.8
GYP5Q12344 YCL019WYCL019W 5313 nt3.84□□□□□ -1.8
GYP5Q12344 XRN1YGL173C 4587 nt3.83□□□□□ -1.8
GYP5Q12344 STU2YLR045C 2667 nt3.83□□□□□ -1.8
GYP5Q12344 YMR317WYMR317W 3423 nt3.83□□□□□ -1.8
GYP5Q12344 YKR075W-AYKR075W-A 270 nt3.83□□□□□ -1.8
GYP5Q12344 SET2YJL168C 2202 nt3.83□□□□□ -1.8
GYP5Q12344 YOR296WYOR296W 3870 nt3.82□□□□□ -1.8
GYP5Q12344 YGL182CYGL182C 324 nt3.82□□□□□ -1.8
GYP5Q12344 YIL002W-AYIL002W-A 210 nt3.82□□□□□ -1.8
GYP5Q12344 YLL054CYLL054C 2532 nt3.82□□□□□ -1.8
GYP5Q12344 TMA108YIL137C 2841 nt3.81□□□□□ -1.8
GYP5Q12344 ANB1YJR047C 474 nt3.81□□□□□ -1.8
GYP5Q12344 tF(GAA)DtF(GAA)D 73 nt3.8□□□□□ -1.8
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 17.9 ms