Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K3

RIPPLY1, Protein ripply1, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY1Q0D2K3 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RIPPLY1Q0D2K3 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RIPPLY1Q0D2K3 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RIPPLY1Q0D2K3 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RIPPLY1Q0D2K3 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RIPPLY1Q0D2K3 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RIPPLY1Q0D2K3 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RIPPLY1Q0D2K3 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RIPPLY1Q0D2K3 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RIPPLY1Q0D2K3 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RIPPLY1Q0D2K3 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RIPPLY1Q0D2K3 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RIPPLY1Q0D2K3 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RIPPLY1Q0D2K3 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
RIPPLY1Q0D2K3 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RIPPLY1Q0D2K3 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RIPPLY1Q0D2K3 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RIPPLY1Q0D2K3 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RIPPLY1Q0D2K3 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RIPPLY1Q0D2K3 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RIPPLY1Q0D2K3 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RIPPLY1Q0D2K3 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RIPPLY1Q0D2K3 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RIPPLY1Q0D2K3 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RIPPLY1Q0D2K3 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RIPPLY1Q0D2K3 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RIPPLY1Q0D2K3 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RIPPLY1Q0D2K3 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
RIPPLY1Q0D2K3 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RIPPLY1Q0D2K3 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RIPPLY1Q0D2K3 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RIPPLY1Q0D2K3 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
RIPPLY1Q0D2K3 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RIPPLY1Q0D2K3 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RIPPLY1Q0D2K3 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
RIPPLY1Q0D2K3 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RIPPLY1Q0D2K3 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RIPPLY1Q0D2K3 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RIPPLY1Q0D2K3 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RIPPLY1Q0D2K3 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RIPPLY1Q0D2K3 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RIPPLY1Q0D2K3 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RIPPLY1Q0D2K3 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RIPPLY1Q0D2K3 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RIPPLY1Q0D2K3 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RIPPLY1Q0D2K3 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RIPPLY1Q0D2K3 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RIPPLY1Q0D2K3 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RIPPLY1Q0D2K3 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RIPPLY1Q0D2K3 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RIPPLY1Q0D2K3 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RIPPLY1Q0D2K3 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RIPPLY1Q0D2K3 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RIPPLY1Q0D2K3 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RIPPLY1Q0D2K3 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RIPPLY1Q0D2K3 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RIPPLY1Q0D2K3 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RIPPLY1Q0D2K3 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RIPPLY1Q0D2K3 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RIPPLY1Q0D2K3 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RIPPLY1Q0D2K3 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RIPPLY1Q0D2K3 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RIPPLY1Q0D2K3 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RIPPLY1Q0D2K3 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RIPPLY1Q0D2K3 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RIPPLY1Q0D2K3 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
RIPPLY1Q0D2K3 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RIPPLY1Q0D2K3 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RIPPLY1Q0D2K3 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RIPPLY1Q0D2K3 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RIPPLY1Q0D2K3 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RIPPLY1Q0D2K3 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RIPPLY1Q0D2K3 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RIPPLY1Q0D2K3 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RIPPLY1Q0D2K3 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RIPPLY1Q0D2K3 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RIPPLY1Q0D2K3 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RIPPLY1Q0D2K3 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RIPPLY1Q0D2K3 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RIPPLY1Q0D2K3 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RIPPLY1Q0D2K3 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RIPPLY1Q0D2K3 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
RIPPLY1Q0D2K3 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RIPPLY1Q0D2K3 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RIPPLY1Q0D2K3 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RIPPLY1Q0D2K3 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RIPPLY1Q0D2K3 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RIPPLY1Q0D2K3 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RIPPLY1Q0D2K3 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RIPPLY1Q0D2K3 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
RIPPLY1Q0D2K3 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
RIPPLY1Q0D2K3 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
RIPPLY1Q0D2K3 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms