Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDE4DQ08499 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDE4DQ08499 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDE4DQ08499 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDE4DQ08499 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDE4DQ08499 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDE4DQ08499 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDE4DQ08499 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDE4DQ08499 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDE4DQ08499 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PDE4DQ08499 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PDE4DQ08499 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDE4DQ08499 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDE4DQ08499 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDE4DQ08499 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDE4DQ08499 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDE4DQ08499 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDE4DQ08499 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDE4DQ08499 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDE4DQ08499 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDE4DQ08499 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDE4DQ08499 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDE4DQ08499 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDE4DQ08499 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDE4DQ08499 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDE4DQ08499 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDE4DQ08499 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDE4DQ08499 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDE4DQ08499 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDE4DQ08499 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDE4DQ08499 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDE4DQ08499 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDE4DQ08499 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDE4DQ08499 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDE4DQ08499 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDE4DQ08499 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDE4DQ08499 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDE4DQ08499 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PDE4DQ08499 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PDE4DQ08499 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PDE4DQ08499 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PDE4DQ08499 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDE4DQ08499 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDE4DQ08499 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDE4DQ08499 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDE4DQ08499 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDE4DQ08499 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDE4DQ08499 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDE4DQ08499 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDE4DQ08499 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PDE4DQ08499 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDE4DQ08499 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDE4DQ08499 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDE4DQ08499 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDE4DQ08499 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDE4DQ08499 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PDE4DQ08499 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PDE4DQ08499 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDE4DQ08499 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PDE4DQ08499 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDE4DQ08499 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDE4DQ08499 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDE4DQ08499 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDE4DQ08499 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDE4DQ08499 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDE4DQ08499 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDE4DQ08499 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDE4DQ08499 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDE4DQ08499 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDE4DQ08499 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDE4DQ08499 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDE4DQ08499 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDE4DQ08499 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDE4DQ08499 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDE4DQ08499 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDE4DQ08499 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDE4DQ08499 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDE4DQ08499 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PDE4DQ08499 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDE4DQ08499 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDE4DQ08499 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDE4DQ08499 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDE4DQ08499 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDE4DQ08499 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDE4DQ08499 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDE4DQ08499 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PDE4DQ08499 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PDE4DQ08499 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PDE4DQ08499 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PDE4DQ08499 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PDE4DQ08499 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDE4DQ08499 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDE4DQ08499 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDE4DQ08499 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDE4DQ08499 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PDE4DQ08499 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDE4DQ08499 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDE4DQ08499 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDE4DQ08499 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDE4DQ08499 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms