Protein–RNA interactions for Protein: Q06889

EGR3, Early growth response protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR3Q06889 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EGR3Q06889 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EGR3Q06889 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EGR3Q06889 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EGR3Q06889 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EGR3Q06889 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EGR3Q06889 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EGR3Q06889 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EGR3Q06889 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EGR3Q06889 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EGR3Q06889 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EGR3Q06889 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EGR3Q06889 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EGR3Q06889 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EGR3Q06889 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EGR3Q06889 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EGR3Q06889 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EGR3Q06889 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EGR3Q06889 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EGR3Q06889 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EGR3Q06889 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EGR3Q06889 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EGR3Q06889 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EGR3Q06889 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EGR3Q06889 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EGR3Q06889 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EGR3Q06889 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EGR3Q06889 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EGR3Q06889 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EGR3Q06889 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EGR3Q06889 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EGR3Q06889 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EGR3Q06889 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EGR3Q06889 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EGR3Q06889 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EGR3Q06889 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EGR3Q06889 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EGR3Q06889 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EGR3Q06889 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EGR3Q06889 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EGR3Q06889 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EGR3Q06889 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EGR3Q06889 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
EGR3Q06889 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
EGR3Q06889 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EGR3Q06889 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EGR3Q06889 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EGR3Q06889 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EGR3Q06889 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EGR3Q06889 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EGR3Q06889 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EGR3Q06889 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EGR3Q06889 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EGR3Q06889 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EGR3Q06889 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EGR3Q06889 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EGR3Q06889 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EGR3Q06889 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
EGR3Q06889 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EGR3Q06889 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EGR3Q06889 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EGR3Q06889 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EGR3Q06889 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EGR3Q06889 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EGR3Q06889 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EGR3Q06889 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EGR3Q06889 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EGR3Q06889 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EGR3Q06889 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EGR3Q06889 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
EGR3Q06889 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EGR3Q06889 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EGR3Q06889 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
EGR3Q06889 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EGR3Q06889 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EGR3Q06889 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EGR3Q06889 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EGR3Q06889 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EGR3Q06889 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EGR3Q06889 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EGR3Q06889 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EGR3Q06889 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EGR3Q06889 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EGR3Q06889 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EGR3Q06889 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EGR3Q06889 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EGR3Q06889 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EGR3Q06889 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EGR3Q06889 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EGR3Q06889 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EGR3Q06889 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EGR3Q06889 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EGR3Q06889 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EGR3Q06889 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EGR3Q06889 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
EGR3Q06889 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EGR3Q06889 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EGR3Q06889 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
EGR3Q06889 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EGR3Q06889 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms