Protein–RNA interactions for Protein: Q03375

CWC21, Pre-mRNA-splicing factor CWC21, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CWC21Q03375 HDA3YPR179C 1968 nt0.89□□□□□ -2.27
CWC21Q03375 YML009C-AYML009C-A 327 nt0.89□□□□□ -2.27
CWC21Q03375 YOR072W-AYOR072W-A 249 nt0.89□□□□□ -2.27
CWC21Q03375 YJR003CYJR003C 1560 nt0.88□□□□□ -2.27
CWC21Q03375 VPS52YDR484W 1926 nt0.88□□□□□ -2.27
CWC21Q03375 tF(GAA)BtF(GAA)B 73 nt0.88□□□□□ -2.27
CWC21Q03375 tF(GAA)FtF(GAA)F 73 nt0.88□□□□□ -2.27
CWC21Q03375 tF(GAA)GtF(GAA)G 73 nt0.88□□□□□ -2.27
CWC21Q03375 tF(GAA)H1tF(GAA)H1 73 nt0.88□□□□□ -2.27
CWC21Q03375 tF(GAA)H2tF(GAA)H2 73 nt0.88□□□□□ -2.27
CWC21Q03375 tF(GAA)MtF(GAA)M 73 nt0.88□□□□□ -2.27
CWC21Q03375 tF(GAA)P1tF(GAA)P1 73 nt0.88□□□□□ -2.27
CWC21Q03375 tF(GAA)P2tF(GAA)P2 73 nt0.88□□□□□ -2.27
CWC21Q03375 YMR304C-AYMR304C-A 351 nt0.88□□□□□ -2.27
CWC21Q03375 YOL106WYOL106W 354 nt0.88□□□□□ -2.27
CWC21Q03375 YDL073WYDL073W 2955 nt0.87□□□□□ -2.27
CWC21Q03375 PRP16YKR086W 3216 nt0.87□□□□□ -2.27
CWC21Q03375 YPR117WYPR117W 7470 nt0.87□□□□□ -2.27
CWC21Q03375 AIM9YER080W 1884 nt0.87□□□□□ -2.27
CWC21Q03375 GPM2YDL021W 936 nt0.87□□□□□ -2.27
CWC21Q03375 LIN1YHR156C 1023 nt0.87□□□□□ -2.27
CWC21Q03375 PHS1YJL097W 654 nt0.87□□□□□ -2.27
CWC21Q03375 SMB1YER029C 591 nt0.86□□□□□ -2.27
CWC21Q03375 YGR045CYGR045C 363 nt0.86□□□□□ -2.27
CWC21Q03375 YIL142C-AYIL142C-A 333 nt0.86□□□□□ -2.27
CWC21Q03375 YNL150WYNL150W 408 nt0.86□□□□□ -2.27
CWC21Q03375 YBR012CYBR012C 420 nt0.86□□□□□ -2.27
CWC21Q03375 NUP157YER105C 4176 nt0.86□□□□□ -2.27
CWC21Q03375 SAG1YJR004C 1953 nt0.85□□□□□ -2.27
CWC21Q03375 CYC7YEL039C 342 nt0.85□□□□□ -2.27
CWC21Q03375 YHR054CYHR054C 1065 nt0.85□□□□□ -2.27
CWC21Q03375 YLR217WYLR217W 324 nt0.85□□□□□ -2.27
CWC21Q03375 YOR032W-AYOR032W-A 201 nt0.85□□□□□ -2.27
CWC21Q03375 RRI2YOL117W 1938 nt0.85□□□□□ -2.27
CWC21Q03375 PAU12YGR294W 363 nt0.84□□□□□ -2.27
CWC21Q03375 YAP3YHL009C 993 nt0.84□□□□□ -2.27
CWC21Q03375 YHR028W-AYHR028W-A 321 nt0.84□□□□□ -2.27
CWC21Q03375 tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 76 nt0.84□□□□□ -2.27
CWC21Q03375 TOF2YKR010C 2316 nt0.84□□□□□ -2.28
CWC21Q03375 NOC3YLR002C 1992 nt0.83□□□□□ -2.28
CWC21Q03375 YDL152WYDL152W 366 nt0.83□□□□□ -2.28
CWC21Q03375 MPT5YGL178W 2580 nt0.82□□□□□ -2.28
CWC21Q03375 YOP1YPR028W 543 nt0.82□□□□□ -2.28
CWC21Q03375 UTP13YLR222C 2454 nt0.82□□□□□ -2.28
CWC21Q03375 snR79snR79 84 nt0.81□□□□□ -2.28
CWC21Q03375 HIT1YJR055W 495 nt0.81□□□□□ -2.28
CWC21Q03375 YJR140W-AYJR140W-A 150 nt0.81□□□□□ -2.28
CWC21Q03375 COX7YMR256C 183 nt0.81□□□□□ -2.28
CWC21Q03375 YBR221W-AYBR221W-A 105 nt0.81□□□□□ -2.28
CWC21Q03375 PIG1YLR273C 1947 nt0.8□□□□□ -2.28
CWC21Q03375 YDR003W-AYDR003W-A 123 nt0.8□□□□□ -2.28
CWC21Q03375 RPL16AYIL133C 600 nt0.8□□□□□ -2.28
CWC21Q03375 YPR170CYPR170C 336 nt0.8□□□□□ -2.28
CWC21Q03375 SEC1YDR164C 2175 nt0.8□□□□□ -2.28
CWC21Q03375 SET3YKR029C 2256 nt0.8□□□□□ -2.28
CWC21Q03375 YCK3YER123W 1575 nt0.79□□□□□ -2.28
CWC21Q03375 ZIP1YDR285W 2628 nt0.79□□□□□ -2.28
CWC21Q03375 QCR9YGR183C 201 nt0.79□□□□□ -2.28
CWC21Q03375 RSM27YGR215W 333 nt0.79□□□□□ -2.28
CWC21Q03375 NBL1YHR199C-A 222 nt0.79□□□□□ -2.28
CWC21Q03375 UBP3YER151C 2739 nt0.79□□□□□ -2.28
CWC21Q03375 TIM10YHR005C-A 282 nt0.78□□□□□ -2.28
CWC21Q03375 CMC4YMR194C-B 222 nt0.78□□□□□ -2.28
CWC21Q03375 NUT2YPR168W 474 nt0.78□□□□□ -2.28
CWC21Q03375 YBR200W-AYBR200W-A 165 nt0.78□□□□□ -2.28
CWC21Q03375 NHP2YDL208W 471 nt0.77□□□□□ -2.29
CWC21Q03375 TAD1YGL243W 1203 nt0.77□□□□□ -2.29
CWC21Q03375 LRP1YHR081W 555 nt0.77□□□□□ -2.29
CWC21Q03375 YMR013C-AYMR013C-A 150 nt0.77□□□□□ -2.29
CWC21Q03375 SWI5YDR146C 2130 nt0.77□□□□□ -2.29
CWC21Q03375 YMR160WYMR160W 2451 nt0.77□□□□□ -2.29
CWC21Q03375 SRP14YDL092W 441 nt0.76□□□□□ -2.29
CWC21Q03375 YIR021W-AYIR021W-A 213 nt0.76□□□□□ -2.29
CWC21Q03375 YBL029C-AYBL029C-A 285 nt0.76□□□□□ -2.29
CWC21Q03375 YPL197CYPL197C 414 nt0.76□□□□□ -2.29
CWC21Q03375 YDL206WYDL206W 2289 nt0.76□□□□□ -2.29
CWC21Q03375 RIM20YOR275C 1986 nt0.76□□□□□ -2.29
CWC21Q03375 YER023C-AYER023C-A 213 nt0.75□□□□□ -2.29
CWC21Q03375 RUF22RUF22 515 nt0.75□□□□□ -2.29
CWC21Q03375 YOR199WYOR199W 330 nt0.75□□□□□ -2.29
CWC21Q03375 YDR521WYDR521W 336 nt0.74□□□□□ -2.29
CWC21Q03375 MXR1YER042W 555 nt0.74□□□□□ -2.29
CWC21Q03375 YFR057WYFR057W 456 nt0.74□□□□□ -2.29
CWC21Q03375 BI4Q0120 1917 nt0.74□□□□□ -2.29
CWC21Q03375 ALY2YJL084C 3141 nt0.73□□□□□ -2.29
CWC21Q03375 YDL196WYDL196W 330 nt0.73□□□□□ -2.29
CWC21Q03375 YER138W-AYER138W-A 105 nt0.73□□□□□ -2.29
CWC21Q03375 YGL109WYGL109W 324 nt0.73□□□□□ -2.29
CWC21Q03375 CWC23YGL128C 852 nt0.73□□□□□ -2.29
CWC21Q03375 tT(AGU)BtT(AGU)B 73 nt0.73□□□□□ -2.29
CWC21Q03375 tT(AGU)CtT(AGU)C 73 nt0.73□□□□□ -2.29
CWC21Q03375 tT(AGU)DtT(AGU)D 73 nt0.73□□□□□ -2.29
CWC21Q03375 tT(AGU)HtT(AGU)H 73 nt0.73□□□□□ -2.29
CWC21Q03375 tT(AGU)I1tT(AGU)I1 73 nt0.73□□□□□ -2.29
CWC21Q03375 tT(AGU)I2tT(AGU)I2 73 nt0.73□□□□□ -2.29
CWC21Q03375 tT(AGU)JtT(AGU)J 73 nt0.73□□□□□ -2.29
CWC21Q03375 tT(AGU)N1tT(AGU)N1 73 nt0.73□□□□□ -2.29
CWC21Q03375 tT(AGU)N2tT(AGU)N2 73 nt0.73□□□□□ -2.29
CWC21Q03375 tT(AGU)O1tT(AGU)O1 73 nt0.73□□□□□ -2.29
CWC21Q03375 tT(AGU)O2tT(AGU)O2 73 nt0.73□□□□□ -2.29
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 47.4 ms