Protein–RNA interactions for Protein: Q02742

GCNT1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT1Q02742 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
GCNT1Q02742 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GCNT1Q02742 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GCNT1Q02742 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
GCNT1Q02742 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GCNT1Q02742 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GCNT1Q02742 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GCNT1Q02742 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GCNT1Q02742 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GCNT1Q02742 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GCNT1Q02742 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GCNT1Q02742 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GCNT1Q02742 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GCNT1Q02742 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
GCNT1Q02742 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GCNT1Q02742 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GCNT1Q02742 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GCNT1Q02742 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GCNT1Q02742 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GCNT1Q02742 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GCNT1Q02742 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GCNT1Q02742 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GCNT1Q02742 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GCNT1Q02742 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GCNT1Q02742 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GCNT1Q02742 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GCNT1Q02742 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GCNT1Q02742 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GCNT1Q02742 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GCNT1Q02742 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GCNT1Q02742 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GCNT1Q02742 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GCNT1Q02742 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GCNT1Q02742 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GCNT1Q02742 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GCNT1Q02742 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GCNT1Q02742 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GCNT1Q02742 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
GCNT1Q02742 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GCNT1Q02742 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
GCNT1Q02742 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GCNT1Q02742 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GCNT1Q02742 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GCNT1Q02742 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GCNT1Q02742 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GCNT1Q02742 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GCNT1Q02742 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GCNT1Q02742 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GCNT1Q02742 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GCNT1Q02742 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GCNT1Q02742 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GCNT1Q02742 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GCNT1Q02742 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GCNT1Q02742 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GCNT1Q02742 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GCNT1Q02742 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GCNT1Q02742 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GCNT1Q02742 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GCNT1Q02742 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GCNT1Q02742 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GCNT1Q02742 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
GCNT1Q02742 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
GCNT1Q02742 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GCNT1Q02742 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GCNT1Q02742 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GCNT1Q02742 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GCNT1Q02742 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GCNT1Q02742 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GCNT1Q02742 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GCNT1Q02742 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GCNT1Q02742 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GCNT1Q02742 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GCNT1Q02742 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GCNT1Q02742 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GCNT1Q02742 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GCNT1Q02742 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GCNT1Q02742 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GCNT1Q02742 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
GCNT1Q02742 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GCNT1Q02742 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GCNT1Q02742 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GCNT1Q02742 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GCNT1Q02742 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GCNT1Q02742 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GCNT1Q02742 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GCNT1Q02742 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GCNT1Q02742 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GCNT1Q02742 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GCNT1Q02742 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GCNT1Q02742 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GCNT1Q02742 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GCNT1Q02742 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GCNT1Q02742 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GCNT1Q02742 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GCNT1Q02742 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GCNT1Q02742 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
GCNT1Q02742 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GCNT1Q02742 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
GCNT1Q02742 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GCNT1Q02742 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms