Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BNC1Q01954 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BNC1Q01954 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BNC1Q01954 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BNC1Q01954 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BNC1Q01954 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BNC1Q01954 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BNC1Q01954 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BNC1Q01954 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BNC1Q01954 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BNC1Q01954 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BNC1Q01954 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BNC1Q01954 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BNC1Q01954 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BNC1Q01954 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BNC1Q01954 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BNC1Q01954 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BNC1Q01954 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BNC1Q01954 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BNC1Q01954 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BNC1Q01954 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BNC1Q01954 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BNC1Q01954 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BNC1Q01954 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BNC1Q01954 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
BNC1Q01954 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BNC1Q01954 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BNC1Q01954 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BNC1Q01954 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BNC1Q01954 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BNC1Q01954 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BNC1Q01954 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BNC1Q01954 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BNC1Q01954 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BNC1Q01954 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BNC1Q01954 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BNC1Q01954 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BNC1Q01954 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BNC1Q01954 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BNC1Q01954 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BNC1Q01954 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BNC1Q01954 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
BNC1Q01954 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BNC1Q01954 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BNC1Q01954 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BNC1Q01954 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BNC1Q01954 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
BNC1Q01954 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BNC1Q01954 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BNC1Q01954 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BNC1Q01954 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BNC1Q01954 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BNC1Q01954 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BNC1Q01954 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BNC1Q01954 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BNC1Q01954 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BNC1Q01954 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BNC1Q01954 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BNC1Q01954 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BNC1Q01954 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BNC1Q01954 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BNC1Q01954 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
BNC1Q01954 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BNC1Q01954 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BNC1Q01954 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BNC1Q01954 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
BNC1Q01954 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
BNC1Q01954 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
BNC1Q01954 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
BNC1Q01954 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
BNC1Q01954 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BNC1Q01954 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BNC1Q01954 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BNC1Q01954 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BNC1Q01954 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
BNC1Q01954 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BNC1Q01954 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BNC1Q01954 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BNC1Q01954 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BNC1Q01954 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BNC1Q01954 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BNC1Q01954 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BNC1Q01954 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BNC1Q01954 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BNC1Q01954 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BNC1Q01954 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BNC1Q01954 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BNC1Q01954 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BNC1Q01954 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
BNC1Q01954 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BNC1Q01954 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BNC1Q01954 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
BNC1Q01954 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BNC1Q01954 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BNC1Q01954 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BNC1Q01954 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BNC1Q01954 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BNC1Q01954 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BNC1Q01954 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BNC1Q01954 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms