Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACADSBP45954 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACADSBP45954 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACADSBP45954 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACADSBP45954 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACADSBP45954 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACADSBP45954 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACADSBP45954 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ACADSBP45954 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACADSBP45954 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACADSBP45954 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACADSBP45954 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACADSBP45954 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACADSBP45954 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACADSBP45954 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACADSBP45954 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACADSBP45954 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACADSBP45954 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ACADSBP45954 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACADSBP45954 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACADSBP45954 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACADSBP45954 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACADSBP45954 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACADSBP45954 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACADSBP45954 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACADSBP45954 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACADSBP45954 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACADSBP45954 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACADSBP45954 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACADSBP45954 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACADSBP45954 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACADSBP45954 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACADSBP45954 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACADSBP45954 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACADSBP45954 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACADSBP45954 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACADSBP45954 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACADSBP45954 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACADSBP45954 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACADSBP45954 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACADSBP45954 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACADSBP45954 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACADSBP45954 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACADSBP45954 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACADSBP45954 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACADSBP45954 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACADSBP45954 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACADSBP45954 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACADSBP45954 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACADSBP45954 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACADSBP45954 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACADSBP45954 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACADSBP45954 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACADSBP45954 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACADSBP45954 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACADSBP45954 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACADSBP45954 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACADSBP45954 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACADSBP45954 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACADSBP45954 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACADSBP45954 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACADSBP45954 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACADSBP45954 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACADSBP45954 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACADSBP45954 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACADSBP45954 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACADSBP45954 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACADSBP45954 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACADSBP45954 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACADSBP45954 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACADSBP45954 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACADSBP45954 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACADSBP45954 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACADSBP45954 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACADSBP45954 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACADSBP45954 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACADSBP45954 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACADSBP45954 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACADSBP45954 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACADSBP45954 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
ACADSBP45954 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACADSBP45954 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACADSBP45954 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACADSBP45954 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACADSBP45954 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACADSBP45954 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACADSBP45954 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACADSBP45954 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACADSBP45954 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACADSBP45954 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACADSBP45954 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACADSBP45954 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACADSBP45954 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
ACADSBP45954 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACADSBP45954 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACADSBP45954 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACADSBP45954 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACADSBP45954 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACADSBP45954 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACADSBP45954 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms