Protein–RNA interactions for Protein: P36406

TRIM23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM23P36406 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM23P36406 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM23P36406 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM23P36406 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM23P36406 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM23P36406 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM23P36406 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM23P36406 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM23P36406 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM23P36406 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM23P36406 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM23P36406 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM23P36406 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM23P36406 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM23P36406 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM23P36406 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM23P36406 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM23P36406 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM23P36406 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM23P36406 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM23P36406 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM23P36406 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM23P36406 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM23P36406 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM23P36406 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM23P36406 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM23P36406 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM23P36406 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM23P36406 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM23P36406 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM23P36406 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM23P36406 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM23P36406 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM23P36406 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM23P36406 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM23P36406 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM23P36406 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM23P36406 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM23P36406 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM23P36406 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM23P36406 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM23P36406 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM23P36406 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM23P36406 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM23P36406 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM23P36406 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM23P36406 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM23P36406 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM23P36406 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM23P36406 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM23P36406 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM23P36406 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM23P36406 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM23P36406 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM23P36406 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM23P36406 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM23P36406 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM23P36406 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM23P36406 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM23P36406 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM23P36406 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM23P36406 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM23P36406 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM23P36406 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM23P36406 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM23P36406 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM23P36406 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM23P36406 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM23P36406 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM23P36406 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM23P36406 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRIM23P36406 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRIM23P36406 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRIM23P36406 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRIM23P36406 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRIM23P36406 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRIM23P36406 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRIM23P36406 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRIM23P36406 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRIM23P36406 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRIM23P36406 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRIM23P36406 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRIM23P36406 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRIM23P36406 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRIM23P36406 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRIM23P36406 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRIM23P36406 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRIM23P36406 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRIM23P36406 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRIM23P36406 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRIM23P36406 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRIM23P36406 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRIM23P36406 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRIM23P36406 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRIM23P36406 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRIM23P36406 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRIM23P36406 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRIM23P36406 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRIM23P36406 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRIM23P36406 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms