Protein–RNA interactions for Protein: P35670

ATP7B, Copper-transporting ATPase 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7BP35670 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
ATP7BP35670 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ATP7BP35670 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ATP7BP35670 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ATP7BP35670 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ATP7BP35670 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
ATP7BP35670 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ATP7BP35670 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ATP7BP35670 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ATP7BP35670 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ATP7BP35670 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ATP7BP35670 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ATP7BP35670 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
ATP7BP35670 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
ATP7BP35670 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
ATP7BP35670 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
ATP7BP35670 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
ATP7BP35670 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
ATP7BP35670 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ATP7BP35670 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ATP7BP35670 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ATP7BP35670 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ATP7BP35670 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ATP7BP35670 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ATP7BP35670 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ATP7BP35670 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ATP7BP35670 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ATP7BP35670 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ATP7BP35670 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ATP7BP35670 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ATP7BP35670 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ATP7BP35670 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ATP7BP35670 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ATP7BP35670 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ATP7BP35670 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
ATP7BP35670 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ATP7BP35670 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ATP7BP35670 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ATP7BP35670 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
ATP7BP35670 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ATP7BP35670 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ATP7BP35670 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ATP7BP35670 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
ATP7BP35670 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
ATP7BP35670 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ATP7BP35670 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ATP7BP35670 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ATP7BP35670 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ATP7BP35670 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ATP7BP35670 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ATP7BP35670 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ATP7BP35670 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ATP7BP35670 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ATP7BP35670 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ATP7BP35670 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ATP7BP35670 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ATP7BP35670 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ATP7BP35670 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ATP7BP35670 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ATP7BP35670 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ATP7BP35670 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ATP7BP35670 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ATP7BP35670 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
ATP7BP35670 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ATP7BP35670 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
ATP7BP35670 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ATP7BP35670 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ATP7BP35670 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ATP7BP35670 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ATP7BP35670 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ATP7BP35670 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ATP7BP35670 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ATP7BP35670 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ATP7BP35670 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ATP7BP35670 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ATP7BP35670 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ATP7BP35670 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ATP7BP35670 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ATP7BP35670 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ATP7BP35670 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ATP7BP35670 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ATP7BP35670 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ATP7BP35670 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ATP7BP35670 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
ATP7BP35670 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ATP7BP35670 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ATP7BP35670 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ATP7BP35670 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ATP7BP35670 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ATP7BP35670 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ATP7BP35670 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
ATP7BP35670 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ATP7BP35670 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ATP7BP35670 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ATP7BP35670 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ATP7BP35670 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ATP7BP35670 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ATP7BP35670 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ATP7BP35670 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ATP7BP35670 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms