Protein–RNA interactions for Protein: P27448

MARK3, MAP/microtubule affinity-regulating kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARK3P27448 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MARK3P27448 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MARK3P27448 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MARK3P27448 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
MARK3P27448 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MARK3P27448 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MARK3P27448 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MARK3P27448 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
MARK3P27448 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
MARK3P27448 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MARK3P27448 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MARK3P27448 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MARK3P27448 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MARK3P27448 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MARK3P27448 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
MARK3P27448 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MARK3P27448 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MARK3P27448 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
MARK3P27448 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MARK3P27448 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MARK3P27448 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MARK3P27448 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MARK3P27448 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MARK3P27448 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MARK3P27448 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MARK3P27448 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MARK3P27448 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MARK3P27448 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MARK3P27448 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MARK3P27448 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MARK3P27448 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MARK3P27448 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MARK3P27448 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MARK3P27448 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MARK3P27448 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MARK3P27448 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MARK3P27448 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MARK3P27448 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MARK3P27448 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MARK3P27448 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MARK3P27448 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MARK3P27448 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MARK3P27448 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MARK3P27448 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MARK3P27448 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MARK3P27448 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MARK3P27448 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MARK3P27448 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MARK3P27448 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MARK3P27448 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
MARK3P27448 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MARK3P27448 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MARK3P27448 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MARK3P27448 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MARK3P27448 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MARK3P27448 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MARK3P27448 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MARK3P27448 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MARK3P27448 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MARK3P27448 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MARK3P27448 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MARK3P27448 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MARK3P27448 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
MARK3P27448 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MARK3P27448 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MARK3P27448 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MARK3P27448 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MARK3P27448 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MARK3P27448 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MARK3P27448 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MARK3P27448 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MARK3P27448 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MARK3P27448 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MARK3P27448 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MARK3P27448 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
MARK3P27448 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MARK3P27448 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MARK3P27448 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MARK3P27448 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MARK3P27448 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MARK3P27448 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MARK3P27448 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MARK3P27448 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MARK3P27448 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MARK3P27448 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MARK3P27448 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MARK3P27448 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MARK3P27448 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MARK3P27448 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MARK3P27448 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
MARK3P27448 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MARK3P27448 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MARK3P27448 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MARK3P27448 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MARK3P27448 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MARK3P27448 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MARK3P27448 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MARK3P27448 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MARK3P27448 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MARK3P27448 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms