Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP4AP20648 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP4AP20648 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP4AP20648 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP4AP20648 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP4AP20648 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP4AP20648 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP4AP20648 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP4AP20648 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP4AP20648 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP4AP20648 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP4AP20648 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP4AP20648 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP4AP20648 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP4AP20648 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP4AP20648 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP4AP20648 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP4AP20648 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP4AP20648 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP4AP20648 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP4AP20648 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP4AP20648 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP4AP20648 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP4AP20648 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP4AP20648 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP4AP20648 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP4AP20648 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP4AP20648 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP4AP20648 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP4AP20648 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP4AP20648 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP4AP20648 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP4AP20648 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP4AP20648 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP4AP20648 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP4AP20648 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP4AP20648 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP4AP20648 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP4AP20648 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP4AP20648 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP4AP20648 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP4AP20648 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP4AP20648 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP4AP20648 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP4AP20648 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP4AP20648 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP4AP20648 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP4AP20648 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP4AP20648 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP4AP20648 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP4AP20648 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP4AP20648 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP4AP20648 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP4AP20648 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP4AP20648 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP4AP20648 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP4AP20648 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP4AP20648 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP4AP20648 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP4AP20648 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP4AP20648 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP4AP20648 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP4AP20648 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP4AP20648 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP4AP20648 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP4AP20648 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP4AP20648 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP4AP20648 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP4AP20648 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP4AP20648 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP4AP20648 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP4AP20648 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP4AP20648 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP4AP20648 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP4AP20648 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP4AP20648 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP4AP20648 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP4AP20648 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP4AP20648 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP4AP20648 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP4AP20648 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP4AP20648 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP4AP20648 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP4AP20648 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP4AP20648 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP4AP20648 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP4AP20648 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP4AP20648 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP4AP20648 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP4AP20648 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP4AP20648 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP4AP20648 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP4AP20648 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP4AP20648 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP4AP20648 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP4AP20648 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP4AP20648 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP4AP20648 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
ATP4AP20648 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP4AP20648 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms