Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

Predictions only

Length 4,074 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
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PKHD1P08F94 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PKHD1P08F94 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PKHD1P08F94 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PKHD1P08F94 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PKHD1P08F94 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
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PKHD1P08F94 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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PKHD1P08F94 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PKHD1P08F94 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PKHD1P08F94 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PKHD1P08F94 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PKHD1P08F94 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PKHD1P08F94 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PKHD1P08F94 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PKHD1P08F94 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PKHD1P08F94 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PKHD1P08F94 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PKHD1P08F94 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PKHD1P08F94 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PKHD1P08F94 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PKHD1P08F94 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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