Protein–RNA interactions for Protein: P08684

CYP3A4, Cytochrome P450 3A4, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP3A4P08684 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CYP3A4P08684 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CYP3A4P08684 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CYP3A4P08684 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CYP3A4P08684 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CYP3A4P08684 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CYP3A4P08684 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CYP3A4P08684 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CYP3A4P08684 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CYP3A4P08684 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CYP3A4P08684 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CYP3A4P08684 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CYP3A4P08684 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CYP3A4P08684 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CYP3A4P08684 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYP3A4P08684 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYP3A4P08684 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CYP3A4P08684 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYP3A4P08684 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYP3A4P08684 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYP3A4P08684 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYP3A4P08684 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYP3A4P08684 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYP3A4P08684 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYP3A4P08684 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYP3A4P08684 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYP3A4P08684 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYP3A4P08684 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CYP3A4P08684 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CYP3A4P08684 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYP3A4P08684 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYP3A4P08684 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYP3A4P08684 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYP3A4P08684 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYP3A4P08684 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYP3A4P08684 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYP3A4P08684 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYP3A4P08684 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYP3A4P08684 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYP3A4P08684 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYP3A4P08684 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYP3A4P08684 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CYP3A4P08684 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYP3A4P08684 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CYP3A4P08684 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYP3A4P08684 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYP3A4P08684 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYP3A4P08684 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYP3A4P08684 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYP3A4P08684 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYP3A4P08684 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYP3A4P08684 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYP3A4P08684 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYP3A4P08684 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYP3A4P08684 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYP3A4P08684 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CYP3A4P08684 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYP3A4P08684 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CYP3A4P08684 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYP3A4P08684 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYP3A4P08684 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYP3A4P08684 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYP3A4P08684 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CYP3A4P08684 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CYP3A4P08684 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CYP3A4P08684 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CYP3A4P08684 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CYP3A4P08684 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CYP3A4P08684 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CYP3A4P08684 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CYP3A4P08684 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CYP3A4P08684 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CYP3A4P08684 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CYP3A4P08684 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CYP3A4P08684 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CYP3A4P08684 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CYP3A4P08684 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CYP3A4P08684 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CYP3A4P08684 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CYP3A4P08684 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CYP3A4P08684 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CYP3A4P08684 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CYP3A4P08684 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CYP3A4P08684 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CYP3A4P08684 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CYP3A4P08684 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CYP3A4P08684 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CYP3A4P08684 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CYP3A4P08684 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CYP3A4P08684 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CYP3A4P08684 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CYP3A4P08684 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CYP3A4P08684 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
CYP3A4P08684 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CYP3A4P08684 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CYP3A4P08684 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CYP3A4P08684 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CYP3A4P08684 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CYP3A4P08684 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CYP3A4P08684 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms