Protein–RNA interactions for Protein: O95819

MAP4K4, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase kinase 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP4K4O95819 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
MAP4K4O95819 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MAP4K4O95819 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MAP4K4O95819 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MAP4K4O95819 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MAP4K4O95819 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MAP4K4O95819 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MAP4K4O95819 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MAP4K4O95819 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MAP4K4O95819 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MAP4K4O95819 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MAP4K4O95819 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
MAP4K4O95819 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MAP4K4O95819 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MAP4K4O95819 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MAP4K4O95819 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MAP4K4O95819 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MAP4K4O95819 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MAP4K4O95819 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MAP4K4O95819 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MAP4K4O95819 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MAP4K4O95819 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MAP4K4O95819 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MAP4K4O95819 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MAP4K4O95819 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MAP4K4O95819 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MAP4K4O95819 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MAP4K4O95819 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MAP4K4O95819 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MAP4K4O95819 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MAP4K4O95819 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MAP4K4O95819 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MAP4K4O95819 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MAP4K4O95819 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MAP4K4O95819 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MAP4K4O95819 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MAP4K4O95819 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MAP4K4O95819 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MAP4K4O95819 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MAP4K4O95819 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
MAP4K4O95819 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
MAP4K4O95819 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MAP4K4O95819 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MAP4K4O95819 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MAP4K4O95819 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MAP4K4O95819 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MAP4K4O95819 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MAP4K4O95819 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MAP4K4O95819 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MAP4K4O95819 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MAP4K4O95819 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MAP4K4O95819 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MAP4K4O95819 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MAP4K4O95819 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MAP4K4O95819 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MAP4K4O95819 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MAP4K4O95819 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
MAP4K4O95819 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MAP4K4O95819 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MAP4K4O95819 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MAP4K4O95819 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MAP4K4O95819 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MAP4K4O95819 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MAP4K4O95819 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MAP4K4O95819 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MAP4K4O95819 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
MAP4K4O95819 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
MAP4K4O95819 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MAP4K4O95819 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MAP4K4O95819 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MAP4K4O95819 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MAP4K4O95819 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MAP4K4O95819 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MAP4K4O95819 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MAP4K4O95819 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MAP4K4O95819 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MAP4K4O95819 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MAP4K4O95819 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MAP4K4O95819 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MAP4K4O95819 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MAP4K4O95819 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MAP4K4O95819 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MAP4K4O95819 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MAP4K4O95819 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MAP4K4O95819 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MAP4K4O95819 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MAP4K4O95819 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MAP4K4O95819 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MAP4K4O95819 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MAP4K4O95819 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MAP4K4O95819 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MAP4K4O95819 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MAP4K4O95819 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MAP4K4O95819 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MAP4K4O95819 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MAP4K4O95819 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MAP4K4O95819 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
MAP4K4O95819 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MAP4K4O95819 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MAP4K4O95819 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms