Protein–RNA interactions for Protein: O95487

SEC24B, Protein transport protein Sec24B, humanhuman

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24BO95487 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SEC24BO95487 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SEC24BO95487 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SEC24BO95487 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SEC24BO95487 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SEC24BO95487 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SEC24BO95487 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SEC24BO95487 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SEC24BO95487 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SEC24BO95487 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SEC24BO95487 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SEC24BO95487 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SEC24BO95487 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SEC24BO95487 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SEC24BO95487 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SEC24BO95487 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SEC24BO95487 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SEC24BO95487 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SEC24BO95487 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SEC24BO95487 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SEC24BO95487 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SEC24BO95487 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SEC24BO95487 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SEC24BO95487 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SEC24BO95487 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SEC24BO95487 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SEC24BO95487 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SEC24BO95487 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SEC24BO95487 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SEC24BO95487 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SEC24BO95487 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SEC24BO95487 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SEC24BO95487 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SEC24BO95487 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SEC24BO95487 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SEC24BO95487 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SEC24BO95487 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SEC24BO95487 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SEC24BO95487 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SEC24BO95487 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SEC24BO95487 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SEC24BO95487 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SEC24BO95487 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SEC24BO95487 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SEC24BO95487 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SEC24BO95487 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SEC24BO95487 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SEC24BO95487 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SEC24BO95487 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SEC24BO95487 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SEC24BO95487 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SEC24BO95487 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SEC24BO95487 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SEC24BO95487 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SEC24BO95487 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SEC24BO95487 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SEC24BO95487 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SEC24BO95487 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SEC24BO95487 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SEC24BO95487 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SEC24BO95487 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SEC24BO95487 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SEC24BO95487 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SEC24BO95487 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SEC24BO95487 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SEC24BO95487 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SEC24BO95487 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SEC24BO95487 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SEC24BO95487 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SEC24BO95487 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SEC24BO95487 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SEC24BO95487 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SEC24BO95487 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SEC24BO95487 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SEC24BO95487 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SEC24BO95487 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SEC24BO95487 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SEC24BO95487 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SEC24BO95487 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SEC24BO95487 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SEC24BO95487 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SEC24BO95487 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SEC24BO95487 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SEC24BO95487 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SEC24BO95487 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SEC24BO95487 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SEC24BO95487 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SEC24BO95487 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SEC24BO95487 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SEC24BO95487 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SEC24BO95487 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SEC24BO95487 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SEC24BO95487 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SEC24BO95487 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SEC24BO95487 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SEC24BO95487 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SEC24BO95487 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SEC24BO95487 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SEC24BO95487 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SEC24BO95487 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms