Protein–RNA interactions for Protein: O95486

SEC24A, Protein transport protein Sec24A, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24AO95486 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SEC24AO95486 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SEC24AO95486 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SEC24AO95486 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SEC24AO95486 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SEC24AO95486 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SEC24AO95486 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SEC24AO95486 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SEC24AO95486 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SEC24AO95486 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SEC24AO95486 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SEC24AO95486 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SEC24AO95486 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SEC24AO95486 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SEC24AO95486 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SEC24AO95486 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SEC24AO95486 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SEC24AO95486 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SEC24AO95486 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SEC24AO95486 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SEC24AO95486 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SEC24AO95486 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SEC24AO95486 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SEC24AO95486 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SEC24AO95486 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SEC24AO95486 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SEC24AO95486 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SEC24AO95486 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SEC24AO95486 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SEC24AO95486 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SEC24AO95486 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
SEC24AO95486 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SEC24AO95486 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SEC24AO95486 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SEC24AO95486 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SEC24AO95486 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SEC24AO95486 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SEC24AO95486 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
SEC24AO95486 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SEC24AO95486 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SEC24AO95486 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
SEC24AO95486 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SEC24AO95486 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SEC24AO95486 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SEC24AO95486 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SEC24AO95486 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SEC24AO95486 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SEC24AO95486 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SEC24AO95486 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SEC24AO95486 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SEC24AO95486 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SEC24AO95486 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SEC24AO95486 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SEC24AO95486 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SEC24AO95486 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SEC24AO95486 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SEC24AO95486 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
SEC24AO95486 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SEC24AO95486 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SEC24AO95486 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SEC24AO95486 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SEC24AO95486 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SEC24AO95486 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SEC24AO95486 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SEC24AO95486 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SEC24AO95486 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SEC24AO95486 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SEC24AO95486 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SEC24AO95486 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SEC24AO95486 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SEC24AO95486 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SEC24AO95486 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SEC24AO95486 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SEC24AO95486 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SEC24AO95486 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SEC24AO95486 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SEC24AO95486 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SEC24AO95486 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SEC24AO95486 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SEC24AO95486 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SEC24AO95486 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SEC24AO95486 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SEC24AO95486 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SEC24AO95486 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SEC24AO95486 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SEC24AO95486 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SEC24AO95486 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SEC24AO95486 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SEC24AO95486 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SEC24AO95486 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
SEC24AO95486 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SEC24AO95486 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SEC24AO95486 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SEC24AO95486 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SEC24AO95486 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SEC24AO95486 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SEC24AO95486 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SEC24AO95486 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SEC24AO95486 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SEC24AO95486 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms