Protein–RNA interactions for Protein: O60504

SORBS3, Vinexin, humanhuman

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORBS3O60504 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SORBS3O60504 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SORBS3O60504 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SORBS3O60504 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SORBS3O60504 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SORBS3O60504 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SORBS3O60504 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SORBS3O60504 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SORBS3O60504 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SORBS3O60504 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SORBS3O60504 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SORBS3O60504 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SORBS3O60504 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SORBS3O60504 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SORBS3O60504 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SORBS3O60504 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SORBS3O60504 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SORBS3O60504 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SORBS3O60504 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SORBS3O60504 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SORBS3O60504 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SORBS3O60504 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SORBS3O60504 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SORBS3O60504 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SORBS3O60504 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SORBS3O60504 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SORBS3O60504 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SORBS3O60504 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SORBS3O60504 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SORBS3O60504 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SORBS3O60504 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SORBS3O60504 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SORBS3O60504 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SORBS3O60504 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SORBS3O60504 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SORBS3O60504 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SORBS3O60504 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SORBS3O60504 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SORBS3O60504 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SORBS3O60504 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SORBS3O60504 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SORBS3O60504 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SORBS3O60504 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SORBS3O60504 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SORBS3O60504 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SORBS3O60504 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SORBS3O60504 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SORBS3O60504 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SORBS3O60504 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SORBS3O60504 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SORBS3O60504 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SORBS3O60504 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SORBS3O60504 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SORBS3O60504 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SORBS3O60504 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SORBS3O60504 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SORBS3O60504 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SORBS3O60504 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SORBS3O60504 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SORBS3O60504 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SORBS3O60504 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SORBS3O60504 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SORBS3O60504 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SORBS3O60504 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SORBS3O60504 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SORBS3O60504 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SORBS3O60504 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SORBS3O60504 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SORBS3O60504 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SORBS3O60504 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SORBS3O60504 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SORBS3O60504 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SORBS3O60504 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SORBS3O60504 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SORBS3O60504 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SORBS3O60504 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SORBS3O60504 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SORBS3O60504 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SORBS3O60504 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SORBS3O60504 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SORBS3O60504 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SORBS3O60504 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SORBS3O60504 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SORBS3O60504 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SORBS3O60504 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SORBS3O60504 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SORBS3O60504 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SORBS3O60504 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SORBS3O60504 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SORBS3O60504 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SORBS3O60504 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SORBS3O60504 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SORBS3O60504 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SORBS3O60504 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SORBS3O60504 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SORBS3O60504 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SORBS3O60504 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SORBS3O60504 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SORBS3O60504 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SORBS3O60504 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms