Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL33

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LQ9UL33 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRAPPC2LQ9UL33 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRAPPC2LQ9UL33 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRAPPC2LQ9UL33 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRAPPC2LQ9UL33 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRAPPC2LQ9UL33 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRAPPC2LQ9UL33 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRAPPC2LQ9UL33 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRAPPC2LQ9UL33 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRAPPC2LQ9UL33 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TRAPPC2LQ9UL33 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TRAPPC2LQ9UL33 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TRAPPC2LQ9UL33 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TRAPPC2LQ9UL33 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TRAPPC2LQ9UL33 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAPPC2LQ9UL33 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAPPC2LQ9UL33 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAPPC2LQ9UL33 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAPPC2LQ9UL33 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAPPC2LQ9UL33 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAPPC2LQ9UL33 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAPPC2LQ9UL33 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAPPC2LQ9UL33 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAPPC2LQ9UL33 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAPPC2LQ9UL33 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAPPC2LQ9UL33 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAPPC2LQ9UL33 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAPPC2LQ9UL33 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAPPC2LQ9UL33 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAPPC2LQ9UL33 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAPPC2LQ9UL33 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAPPC2LQ9UL33 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAPPC2LQ9UL33 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAPPC2LQ9UL33 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAPPC2LQ9UL33 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TRAPPC2LQ9UL33 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TRAPPC2LQ9UL33 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
TRAPPC2LQ9UL33 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRAPPC2LQ9UL33 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRAPPC2LQ9UL33 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TRAPPC2LQ9UL33 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRAPPC2LQ9UL33 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TRAPPC2LQ9UL33 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRAPPC2LQ9UL33 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRAPPC2LQ9UL33 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TRAPPC2LQ9UL33 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
TRAPPC2LQ9UL33 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRAPPC2LQ9UL33 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TRAPPC2LQ9UL33 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRAPPC2LQ9UL33 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TRAPPC2LQ9UL33 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRAPPC2LQ9UL33 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TRAPPC2LQ9UL33 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRAPPC2LQ9UL33 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRAPPC2LQ9UL33 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAPPC2LQ9UL33 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAPPC2LQ9UL33 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAPPC2LQ9UL33 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAPPC2LQ9UL33 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAPPC2LQ9UL33 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAPPC2LQ9UL33 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAPPC2LQ9UL33 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAPPC2LQ9UL33 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAPPC2LQ9UL33 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAPPC2LQ9UL33 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAPPC2LQ9UL33 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAPPC2LQ9UL33 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAPPC2LQ9UL33 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAPPC2LQ9UL33 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAPPC2LQ9UL33 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAPPC2LQ9UL33 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAPPC2LQ9UL33 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAPPC2LQ9UL33 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAPPC2LQ9UL33 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAPPC2LQ9UL33 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAPPC2LQ9UL33 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAPPC2LQ9UL33 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAPPC2LQ9UL33 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAPPC2LQ9UL33 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAPPC2LQ9UL33 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAPPC2LQ9UL33 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAPPC2LQ9UL33 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAPPC2LQ9UL33 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAPPC2LQ9UL33 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAPPC2LQ9UL33 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAPPC2LQ9UL33 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAPPC2LQ9UL33 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAPPC2LQ9UL33 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAPPC2LQ9UL33 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAPPC2LQ9UL33 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAPPC2LQ9UL33 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAPPC2LQ9UL33 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAPPC2LQ9UL33 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAPPC2LQ9UL33 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAPPC2LQ9UL33 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAPPC2LQ9UL33 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAPPC2LQ9UL33 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAPPC2LQ9UL33 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms