Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKL3

CASP8AP2, CASP8-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,982 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP8AP2Q9UKL3 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CASP8AP2Q9UKL3 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CASP8AP2Q9UKL3 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CASP8AP2Q9UKL3 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CASP8AP2Q9UKL3 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CASP8AP2Q9UKL3 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CASP8AP2Q9UKL3 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CASP8AP2Q9UKL3 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CASP8AP2Q9UKL3 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CASP8AP2Q9UKL3 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CASP8AP2Q9UKL3 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CASP8AP2Q9UKL3 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CASP8AP2Q9UKL3 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CASP8AP2Q9UKL3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CASP8AP2Q9UKL3 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CASP8AP2Q9UKL3 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CASP8AP2Q9UKL3 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CASP8AP2Q9UKL3 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CASP8AP2Q9UKL3 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CASP8AP2Q9UKL3 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CASP8AP2Q9UKL3 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CASP8AP2Q9UKL3 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CASP8AP2Q9UKL3 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CASP8AP2Q9UKL3 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CASP8AP2Q9UKL3 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CASP8AP2Q9UKL3 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CASP8AP2Q9UKL3 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CASP8AP2Q9UKL3 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CASP8AP2Q9UKL3 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CASP8AP2Q9UKL3 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CASP8AP2Q9UKL3 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CASP8AP2Q9UKL3 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CASP8AP2Q9UKL3 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CASP8AP2Q9UKL3 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CASP8AP2Q9UKL3 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CASP8AP2Q9UKL3 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CASP8AP2Q9UKL3 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CASP8AP2Q9UKL3 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CASP8AP2Q9UKL3 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CASP8AP2Q9UKL3 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CASP8AP2Q9UKL3 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CASP8AP2Q9UKL3 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CASP8AP2Q9UKL3 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CASP8AP2Q9UKL3 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CASP8AP2Q9UKL3 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CASP8AP2Q9UKL3 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CASP8AP2Q9UKL3 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CASP8AP2Q9UKL3 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CASP8AP2Q9UKL3 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CASP8AP2Q9UKL3 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CASP8AP2Q9UKL3 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CASP8AP2Q9UKL3 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CASP8AP2Q9UKL3 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CASP8AP2Q9UKL3 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CASP8AP2Q9UKL3 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CASP8AP2Q9UKL3 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CASP8AP2Q9UKL3 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CASP8AP2Q9UKL3 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CASP8AP2Q9UKL3 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CASP8AP2Q9UKL3 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CASP8AP2Q9UKL3 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CASP8AP2Q9UKL3 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CASP8AP2Q9UKL3 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CASP8AP2Q9UKL3 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CASP8AP2Q9UKL3 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CASP8AP2Q9UKL3 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CASP8AP2Q9UKL3 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CASP8AP2Q9UKL3 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CASP8AP2Q9UKL3 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CASP8AP2Q9UKL3 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CASP8AP2Q9UKL3 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CASP8AP2Q9UKL3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CASP8AP2Q9UKL3 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CASP8AP2Q9UKL3 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CASP8AP2Q9UKL3 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CASP8AP2Q9UKL3 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CASP8AP2Q9UKL3 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CASP8AP2Q9UKL3 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CASP8AP2Q9UKL3 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CASP8AP2Q9UKL3 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CASP8AP2Q9UKL3 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CASP8AP2Q9UKL3 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CASP8AP2Q9UKL3 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CASP8AP2Q9UKL3 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CASP8AP2Q9UKL3 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CASP8AP2Q9UKL3 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CASP8AP2Q9UKL3 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CASP8AP2Q9UKL3 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CASP8AP2Q9UKL3 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CASP8AP2Q9UKL3 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CASP8AP2Q9UKL3 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CASP8AP2Q9UKL3 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CASP8AP2Q9UKL3 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CASP8AP2Q9UKL3 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CASP8AP2Q9UKL3 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CASP8AP2Q9UKL3 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CASP8AP2Q9UKL3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CASP8AP2Q9UKL3 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CASP8AP2Q9UKL3 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CASP8AP2Q9UKL3 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms