Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKA8

RCAN3, Calcipressin-3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCAN3Q9UKA8 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RCAN3Q9UKA8 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RCAN3Q9UKA8 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RCAN3Q9UKA8 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RCAN3Q9UKA8 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
RCAN3Q9UKA8 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RCAN3Q9UKA8 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RCAN3Q9UKA8 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RCAN3Q9UKA8 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RCAN3Q9UKA8 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RCAN3Q9UKA8 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RCAN3Q9UKA8 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RCAN3Q9UKA8 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RCAN3Q9UKA8 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RCAN3Q9UKA8 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RCAN3Q9UKA8 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RCAN3Q9UKA8 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RCAN3Q9UKA8 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RCAN3Q9UKA8 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RCAN3Q9UKA8 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RCAN3Q9UKA8 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RCAN3Q9UKA8 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RCAN3Q9UKA8 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RCAN3Q9UKA8 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RCAN3Q9UKA8 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RCAN3Q9UKA8 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RCAN3Q9UKA8 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RCAN3Q9UKA8 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RCAN3Q9UKA8 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RCAN3Q9UKA8 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
RCAN3Q9UKA8 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RCAN3Q9UKA8 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RCAN3Q9UKA8 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RCAN3Q9UKA8 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RCAN3Q9UKA8 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
RCAN3Q9UKA8 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RCAN3Q9UKA8 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RCAN3Q9UKA8 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RCAN3Q9UKA8 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RCAN3Q9UKA8 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RCAN3Q9UKA8 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RCAN3Q9UKA8 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RCAN3Q9UKA8 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
RCAN3Q9UKA8 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RCAN3Q9UKA8 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RCAN3Q9UKA8 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RCAN3Q9UKA8 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RCAN3Q9UKA8 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RCAN3Q9UKA8 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RCAN3Q9UKA8 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RCAN3Q9UKA8 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RCAN3Q9UKA8 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RCAN3Q9UKA8 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RCAN3Q9UKA8 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RCAN3Q9UKA8 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RCAN3Q9UKA8 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RCAN3Q9UKA8 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RCAN3Q9UKA8 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RCAN3Q9UKA8 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RCAN3Q9UKA8 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RCAN3Q9UKA8 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RCAN3Q9UKA8 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RCAN3Q9UKA8 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RCAN3Q9UKA8 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RCAN3Q9UKA8 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RCAN3Q9UKA8 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RCAN3Q9UKA8 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RCAN3Q9UKA8 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RCAN3Q9UKA8 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RCAN3Q9UKA8 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RCAN3Q9UKA8 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RCAN3Q9UKA8 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RCAN3Q9UKA8 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RCAN3Q9UKA8 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RCAN3Q9UKA8 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RCAN3Q9UKA8 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RCAN3Q9UKA8 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RCAN3Q9UKA8 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RCAN3Q9UKA8 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RCAN3Q9UKA8 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RCAN3Q9UKA8 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RCAN3Q9UKA8 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RCAN3Q9UKA8 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RCAN3Q9UKA8 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RCAN3Q9UKA8 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RCAN3Q9UKA8 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RCAN3Q9UKA8 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RCAN3Q9UKA8 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RCAN3Q9UKA8 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RCAN3Q9UKA8 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
RCAN3Q9UKA8 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RCAN3Q9UKA8 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RCAN3Q9UKA8 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RCAN3Q9UKA8 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RCAN3Q9UKA8 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RCAN3Q9UKA8 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RCAN3Q9UKA8 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RCAN3Q9UKA8 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RCAN3Q9UKA8 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RCAN3Q9UKA8 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms