Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTNNA3Q9UI47 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTNNA3Q9UI47 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTNNA3Q9UI47 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTNNA3Q9UI47 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTNNA3Q9UI47 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTNNA3Q9UI47 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CTNNA3Q9UI47 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTNNA3Q9UI47 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTNNA3Q9UI47 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTNNA3Q9UI47 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTNNA3Q9UI47 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTNNA3Q9UI47 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTNNA3Q9UI47 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTNNA3Q9UI47 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTNNA3Q9UI47 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTNNA3Q9UI47 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTNNA3Q9UI47 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTNNA3Q9UI47 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTNNA3Q9UI47 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTNNA3Q9UI47 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTNNA3Q9UI47 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTNNA3Q9UI47 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTNNA3Q9UI47 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTNNA3Q9UI47 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTNNA3Q9UI47 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTNNA3Q9UI47 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTNNA3Q9UI47 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTNNA3Q9UI47 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTNNA3Q9UI47 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTNNA3Q9UI47 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTNNA3Q9UI47 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTNNA3Q9UI47 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTNNA3Q9UI47 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTNNA3Q9UI47 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTNNA3Q9UI47 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTNNA3Q9UI47 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTNNA3Q9UI47 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTNNA3Q9UI47 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTNNA3Q9UI47 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTNNA3Q9UI47 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTNNA3Q9UI47 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTNNA3Q9UI47 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTNNA3Q9UI47 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTNNA3Q9UI47 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTNNA3Q9UI47 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTNNA3Q9UI47 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTNNA3Q9UI47 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTNNA3Q9UI47 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTNNA3Q9UI47 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTNNA3Q9UI47 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTNNA3Q9UI47 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTNNA3Q9UI47 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTNNA3Q9UI47 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTNNA3Q9UI47 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTNNA3Q9UI47 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTNNA3Q9UI47 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTNNA3Q9UI47 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CTNNA3Q9UI47 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTNNA3Q9UI47 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTNNA3Q9UI47 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTNNA3Q9UI47 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTNNA3Q9UI47 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CTNNA3Q9UI47 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CTNNA3Q9UI47 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CTNNA3Q9UI47 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CTNNA3Q9UI47 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CTNNA3Q9UI47 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CTNNA3Q9UI47 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CTNNA3Q9UI47 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CTNNA3Q9UI47 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CTNNA3Q9UI47 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CTNNA3Q9UI47 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CTNNA3Q9UI47 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CTNNA3Q9UI47 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CTNNA3Q9UI47 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CTNNA3Q9UI47 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CTNNA3Q9UI47 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CTNNA3Q9UI47 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTNNA3Q9UI47 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTNNA3Q9UI47 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTNNA3Q9UI47 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTNNA3Q9UI47 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTNNA3Q9UI47 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTNNA3Q9UI47 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTNNA3Q9UI47 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTNNA3Q9UI47 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CTNNA3Q9UI47 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CTNNA3Q9UI47 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CTNNA3Q9UI47 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTNNA3Q9UI47 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTNNA3Q9UI47 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTNNA3Q9UI47 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTNNA3Q9UI47 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTNNA3Q9UI47 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CTNNA3Q9UI47 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTNNA3Q9UI47 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTNNA3Q9UI47 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTNNA3Q9UI47 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTNNA3Q9UI47 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms