Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W2

HMG20B, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1-related, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20BQ9P0W2 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HMG20BQ9P0W2 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HMG20BQ9P0W2 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HMG20BQ9P0W2 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HMG20BQ9P0W2 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HMG20BQ9P0W2 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HMG20BQ9P0W2 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HMG20BQ9P0W2 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
HMG20BQ9P0W2 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HMG20BQ9P0W2 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
HMG20BQ9P0W2 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HMG20BQ9P0W2 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HMG20BQ9P0W2 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HMG20BQ9P0W2 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HMG20BQ9P0W2 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
HMG20BQ9P0W2 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
HMG20BQ9P0W2 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
HMG20BQ9P0W2 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HMG20BQ9P0W2 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HMG20BQ9P0W2 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HMG20BQ9P0W2 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
HMG20BQ9P0W2 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HMG20BQ9P0W2 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HMG20BQ9P0W2 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HMG20BQ9P0W2 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HMG20BQ9P0W2 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HMG20BQ9P0W2 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HMG20BQ9P0W2 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HMG20BQ9P0W2 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
HMG20BQ9P0W2 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HMG20BQ9P0W2 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HMG20BQ9P0W2 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HMG20BQ9P0W2 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HMG20BQ9P0W2 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HMG20BQ9P0W2 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HMG20BQ9P0W2 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HMG20BQ9P0W2 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HMG20BQ9P0W2 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HMG20BQ9P0W2 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HMG20BQ9P0W2 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HMG20BQ9P0W2 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HMG20BQ9P0W2 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HMG20BQ9P0W2 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HMG20BQ9P0W2 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HMG20BQ9P0W2 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HMG20BQ9P0W2 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HMG20BQ9P0W2 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HMG20BQ9P0W2 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HMG20BQ9P0W2 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HMG20BQ9P0W2 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HMG20BQ9P0W2 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HMG20BQ9P0W2 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HMG20BQ9P0W2 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HMG20BQ9P0W2 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HMG20BQ9P0W2 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HMG20BQ9P0W2 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HMG20BQ9P0W2 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HMG20BQ9P0W2 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
HMG20BQ9P0W2 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HMG20BQ9P0W2 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
HMG20BQ9P0W2 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HMG20BQ9P0W2 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HMG20BQ9P0W2 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HMG20BQ9P0W2 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HMG20BQ9P0W2 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HMG20BQ9P0W2 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HMG20BQ9P0W2 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HMG20BQ9P0W2 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HMG20BQ9P0W2 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HMG20BQ9P0W2 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HMG20BQ9P0W2 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HMG20BQ9P0W2 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HMG20BQ9P0W2 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HMG20BQ9P0W2 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HMG20BQ9P0W2 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HMG20BQ9P0W2 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HMG20BQ9P0W2 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HMG20BQ9P0W2 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HMG20BQ9P0W2 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HMG20BQ9P0W2 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
HMG20BQ9P0W2 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
HMG20BQ9P0W2 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HMG20BQ9P0W2 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HMG20BQ9P0W2 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HMG20BQ9P0W2 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HMG20BQ9P0W2 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HMG20BQ9P0W2 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HMG20BQ9P0W2 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HMG20BQ9P0W2 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HMG20BQ9P0W2 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HMG20BQ9P0W2 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HMG20BQ9P0W2 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HMG20BQ9P0W2 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HMG20BQ9P0W2 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HMG20BQ9P0W2 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HMG20BQ9P0W2 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HMG20BQ9P0W2 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HMG20BQ9P0W2 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
HMG20BQ9P0W2 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HMG20BQ9P0W2 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms