Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXH8

TOR4A, Torsin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOR4AQ9NXH8 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TOR4AQ9NXH8 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TOR4AQ9NXH8 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TOR4AQ9NXH8 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TOR4AQ9NXH8 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TOR4AQ9NXH8 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TOR4AQ9NXH8 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TOR4AQ9NXH8 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TOR4AQ9NXH8 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TOR4AQ9NXH8 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TOR4AQ9NXH8 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
TOR4AQ9NXH8 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TOR4AQ9NXH8 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TOR4AQ9NXH8 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TOR4AQ9NXH8 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
TOR4AQ9NXH8 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
TOR4AQ9NXH8 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TOR4AQ9NXH8 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TOR4AQ9NXH8 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TOR4AQ9NXH8 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TOR4AQ9NXH8 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TOR4AQ9NXH8 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TOR4AQ9NXH8 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TOR4AQ9NXH8 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TOR4AQ9NXH8 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TOR4AQ9NXH8 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TOR4AQ9NXH8 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TOR4AQ9NXH8 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TOR4AQ9NXH8 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TOR4AQ9NXH8 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TOR4AQ9NXH8 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TOR4AQ9NXH8 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TOR4AQ9NXH8 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TOR4AQ9NXH8 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TOR4AQ9NXH8 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TOR4AQ9NXH8 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TOR4AQ9NXH8 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TOR4AQ9NXH8 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TOR4AQ9NXH8 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TOR4AQ9NXH8 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TOR4AQ9NXH8 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TOR4AQ9NXH8 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TOR4AQ9NXH8 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TOR4AQ9NXH8 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TOR4AQ9NXH8 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TOR4AQ9NXH8 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TOR4AQ9NXH8 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TOR4AQ9NXH8 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TOR4AQ9NXH8 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TOR4AQ9NXH8 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TOR4AQ9NXH8 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TOR4AQ9NXH8 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TOR4AQ9NXH8 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TOR4AQ9NXH8 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TOR4AQ9NXH8 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TOR4AQ9NXH8 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TOR4AQ9NXH8 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TOR4AQ9NXH8 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TOR4AQ9NXH8 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TOR4AQ9NXH8 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TOR4AQ9NXH8 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TOR4AQ9NXH8 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TOR4AQ9NXH8 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TOR4AQ9NXH8 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TOR4AQ9NXH8 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TOR4AQ9NXH8 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TOR4AQ9NXH8 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TOR4AQ9NXH8 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TOR4AQ9NXH8 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TOR4AQ9NXH8 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TOR4AQ9NXH8 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TOR4AQ9NXH8 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
TOR4AQ9NXH8 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TOR4AQ9NXH8 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TOR4AQ9NXH8 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TOR4AQ9NXH8 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
TOR4AQ9NXH8 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TOR4AQ9NXH8 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TOR4AQ9NXH8 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TOR4AQ9NXH8 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TOR4AQ9NXH8 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TOR4AQ9NXH8 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TOR4AQ9NXH8 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TOR4AQ9NXH8 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TOR4AQ9NXH8 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
TOR4AQ9NXH8 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TOR4AQ9NXH8 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TOR4AQ9NXH8 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
TOR4AQ9NXH8 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TOR4AQ9NXH8 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TOR4AQ9NXH8 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TOR4AQ9NXH8 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TOR4AQ9NXH8 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TOR4AQ9NXH8 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TOR4AQ9NXH8 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TOR4AQ9NXH8 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TOR4AQ9NXH8 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TOR4AQ9NXH8 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TOR4AQ9NXH8 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TOR4AQ9NXH8 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms