Protein–RNA interactions for Protein: Q9H875

PRKRIP1, PRKR-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKRIP1Q9H875 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRKRIP1Q9H875 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRKRIP1Q9H875 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRKRIP1Q9H875 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRKRIP1Q9H875 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRKRIP1Q9H875 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRKRIP1Q9H875 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRKRIP1Q9H875 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRKRIP1Q9H875 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PRKRIP1Q9H875 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PRKRIP1Q9H875 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PRKRIP1Q9H875 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PRKRIP1Q9H875 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PRKRIP1Q9H875 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PRKRIP1Q9H875 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PRKRIP1Q9H875 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PRKRIP1Q9H875 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PRKRIP1Q9H875 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PRKRIP1Q9H875 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PRKRIP1Q9H875 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PRKRIP1Q9H875 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PRKRIP1Q9H875 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PRKRIP1Q9H875 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PRKRIP1Q9H875 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PRKRIP1Q9H875 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PRKRIP1Q9H875 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PRKRIP1Q9H875 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
PRKRIP1Q9H875 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PRKRIP1Q9H875 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC27.57■■■□□ 2
PRKRIP1Q9H875 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC27.57■■■□□ 2
PRKRIP1Q9H875 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
PRKRIP1Q9H875 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC27.57■■■□□ 2
PRKRIP1Q9H875 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PRKRIP1Q9H875 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC27.57■■■□□ 2
PRKRIP1Q9H875 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
PRKRIP1Q9H875 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC27.57■■■□□ 2
PRKRIP1Q9H875 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PRKRIP1Q9H875 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PRKRIP1Q9H875 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PRKRIP1Q9H875 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PRKRIP1Q9H875 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PRKRIP1Q9H875 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
PRKRIP1Q9H875 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PRKRIP1Q9H875 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PRKRIP1Q9H875 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PRKRIP1Q9H875 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PRKRIP1Q9H875 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.56■■■□□ 2
PRKRIP1Q9H875 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PRKRIP1Q9H875 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PRKRIP1Q9H875 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
PRKRIP1Q9H875 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PRKRIP1Q9H875 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
PRKRIP1Q9H875 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PRKRIP1Q9H875 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
PRKRIP1Q9H875 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PRKRIP1Q9H875 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PRKRIP1Q9H875 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PRKRIP1Q9H875 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PRKRIP1Q9H875 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PRKRIP1Q9H875 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC27.56■■■□□ 2
PRKRIP1Q9H875 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PRKRIP1Q9H875 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PRKRIP1Q9H875 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PRKRIP1Q9H875 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PRKRIP1Q9H875 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PRKRIP1Q9H875 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PRKRIP1Q9H875 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PRKRIP1Q9H875 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PRKRIP1Q9H875 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PRKRIP1Q9H875 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PRKRIP1Q9H875 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PRKRIP1Q9H875 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
PRKRIP1Q9H875 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PRKRIP1Q9H875 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PRKRIP1Q9H875 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PRKRIP1Q9H875 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PRKRIP1Q9H875 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PRKRIP1Q9H875 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PRKRIP1Q9H875 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
PRKRIP1Q9H875 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
PRKRIP1Q9H875 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
PRKRIP1Q9H875 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC27.54■■■□□ 2
PRKRIP1Q9H875 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PRKRIP1Q9H875 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC27.53■■■□□ 2
PRKRIP1Q9H875 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PRKRIP1Q9H875 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PRKRIP1Q9H875 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PRKRIP1Q9H875 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PRKRIP1Q9H875 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PRKRIP1Q9H875 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PRKRIP1Q9H875 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PRKRIP1Q9H875 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PRKRIP1Q9H875 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC27.53■■■□□ 2
PRKRIP1Q9H875 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PRKRIP1Q9H875 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PRKRIP1Q9H875 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
PRKRIP1Q9H875 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PRKRIP1Q9H875 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PRKRIP1Q9H875 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PRKRIP1Q9H875 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms