Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZQ6

EDEM3, ER degradation-enhancing alpha-mannosidase-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDEM3Q9BZQ6 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
EDEM3Q9BZQ6 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
EDEM3Q9BZQ6 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
EDEM3Q9BZQ6 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EDEM3Q9BZQ6 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
EDEM3Q9BZQ6 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
EDEM3Q9BZQ6 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
EDEM3Q9BZQ6 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
EDEM3Q9BZQ6 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EDEM3Q9BZQ6 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
EDEM3Q9BZQ6 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EDEM3Q9BZQ6 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EDEM3Q9BZQ6 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
EDEM3Q9BZQ6 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EDEM3Q9BZQ6 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EDEM3Q9BZQ6 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
EDEM3Q9BZQ6 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
EDEM3Q9BZQ6 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
EDEM3Q9BZQ6 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
EDEM3Q9BZQ6 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
EDEM3Q9BZQ6 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
EDEM3Q9BZQ6 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
EDEM3Q9BZQ6 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
EDEM3Q9BZQ6 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
EDEM3Q9BZQ6 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
EDEM3Q9BZQ6 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
EDEM3Q9BZQ6 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
EDEM3Q9BZQ6 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
EDEM3Q9BZQ6 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
EDEM3Q9BZQ6 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
EDEM3Q9BZQ6 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
EDEM3Q9BZQ6 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
EDEM3Q9BZQ6 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
EDEM3Q9BZQ6 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
EDEM3Q9BZQ6 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
EDEM3Q9BZQ6 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
EDEM3Q9BZQ6 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
EDEM3Q9BZQ6 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
EDEM3Q9BZQ6 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
EDEM3Q9BZQ6 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
EDEM3Q9BZQ6 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
EDEM3Q9BZQ6 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
EDEM3Q9BZQ6 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EDEM3Q9BZQ6 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EDEM3Q9BZQ6 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EDEM3Q9BZQ6 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
EDEM3Q9BZQ6 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EDEM3Q9BZQ6 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EDEM3Q9BZQ6 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EDEM3Q9BZQ6 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EDEM3Q9BZQ6 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
EDEM3Q9BZQ6 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EDEM3Q9BZQ6 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EDEM3Q9BZQ6 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
EDEM3Q9BZQ6 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
EDEM3Q9BZQ6 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EDEM3Q9BZQ6 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EDEM3Q9BZQ6 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
EDEM3Q9BZQ6 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EDEM3Q9BZQ6 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
EDEM3Q9BZQ6 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
EDEM3Q9BZQ6 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
EDEM3Q9BZQ6 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
EDEM3Q9BZQ6 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
EDEM3Q9BZQ6 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
EDEM3Q9BZQ6 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
EDEM3Q9BZQ6 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
EDEM3Q9BZQ6 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
EDEM3Q9BZQ6 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
EDEM3Q9BZQ6 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
EDEM3Q9BZQ6 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
EDEM3Q9BZQ6 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
EDEM3Q9BZQ6 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
EDEM3Q9BZQ6 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
EDEM3Q9BZQ6 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
EDEM3Q9BZQ6 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
EDEM3Q9BZQ6 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
EDEM3Q9BZQ6 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
EDEM3Q9BZQ6 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
EDEM3Q9BZQ6 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
EDEM3Q9BZQ6 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
EDEM3Q9BZQ6 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EDEM3Q9BZQ6 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EDEM3Q9BZQ6 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EDEM3Q9BZQ6 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EDEM3Q9BZQ6 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EDEM3Q9BZQ6 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
EDEM3Q9BZQ6 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EDEM3Q9BZQ6 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EDEM3Q9BZQ6 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
EDEM3Q9BZQ6 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
EDEM3Q9BZQ6 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EDEM3Q9BZQ6 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
EDEM3Q9BZQ6 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
EDEM3Q9BZQ6 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EDEM3Q9BZQ6 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EDEM3Q9BZQ6 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EDEM3Q9BZQ6 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EDEM3Q9BZQ6 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
EDEM3Q9BZQ6 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms