Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT4

TDRD1, Tudor domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD1Q9BXT4 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TDRD1Q9BXT4 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TDRD1Q9BXT4 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TDRD1Q9BXT4 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TDRD1Q9BXT4 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TDRD1Q9BXT4 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TDRD1Q9BXT4 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TDRD1Q9BXT4 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TDRD1Q9BXT4 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TDRD1Q9BXT4 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TDRD1Q9BXT4 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TDRD1Q9BXT4 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TDRD1Q9BXT4 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TDRD1Q9BXT4 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TDRD1Q9BXT4 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TDRD1Q9BXT4 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TDRD1Q9BXT4 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TDRD1Q9BXT4 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TDRD1Q9BXT4 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TDRD1Q9BXT4 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TDRD1Q9BXT4 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TDRD1Q9BXT4 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TDRD1Q9BXT4 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TDRD1Q9BXT4 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TDRD1Q9BXT4 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TDRD1Q9BXT4 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TDRD1Q9BXT4 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TDRD1Q9BXT4 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TDRD1Q9BXT4 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TDRD1Q9BXT4 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TDRD1Q9BXT4 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
TDRD1Q9BXT4 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TDRD1Q9BXT4 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TDRD1Q9BXT4 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
TDRD1Q9BXT4 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TDRD1Q9BXT4 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TDRD1Q9BXT4 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TDRD1Q9BXT4 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TDRD1Q9BXT4 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TDRD1Q9BXT4 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TDRD1Q9BXT4 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TDRD1Q9BXT4 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TDRD1Q9BXT4 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TDRD1Q9BXT4 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TDRD1Q9BXT4 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TDRD1Q9BXT4 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TDRD1Q9BXT4 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
TDRD1Q9BXT4 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TDRD1Q9BXT4 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TDRD1Q9BXT4 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
TDRD1Q9BXT4 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
TDRD1Q9BXT4 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TDRD1Q9BXT4 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TDRD1Q9BXT4 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TDRD1Q9BXT4 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TDRD1Q9BXT4 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TDRD1Q9BXT4 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TDRD1Q9BXT4 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TDRD1Q9BXT4 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TDRD1Q9BXT4 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TDRD1Q9BXT4 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TDRD1Q9BXT4 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TDRD1Q9BXT4 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TDRD1Q9BXT4 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TDRD1Q9BXT4 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TDRD1Q9BXT4 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TDRD1Q9BXT4 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TDRD1Q9BXT4 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TDRD1Q9BXT4 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TDRD1Q9BXT4 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TDRD1Q9BXT4 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TDRD1Q9BXT4 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TDRD1Q9BXT4 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TDRD1Q9BXT4 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TDRD1Q9BXT4 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TDRD1Q9BXT4 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TDRD1Q9BXT4 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TDRD1Q9BXT4 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TDRD1Q9BXT4 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TDRD1Q9BXT4 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TDRD1Q9BXT4 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
TDRD1Q9BXT4 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TDRD1Q9BXT4 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TDRD1Q9BXT4 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TDRD1Q9BXT4 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
TDRD1Q9BXT4 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TDRD1Q9BXT4 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TDRD1Q9BXT4 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TDRD1Q9BXT4 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TDRD1Q9BXT4 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TDRD1Q9BXT4 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TDRD1Q9BXT4 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TDRD1Q9BXT4 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TDRD1Q9BXT4 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TDRD1Q9BXT4 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TDRD1Q9BXT4 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TDRD1Q9BXT4 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TDRD1Q9BXT4 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TDRD1Q9BXT4 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TDRD1Q9BXT4 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms