Protein–RNA interactions for Protein: Q96IS3

RAX2, Retina and anterior neural fold homeobox protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAX2Q96IS3 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAX2Q96IS3 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAX2Q96IS3 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAX2Q96IS3 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAX2Q96IS3 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAX2Q96IS3 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAX2Q96IS3 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAX2Q96IS3 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RAX2Q96IS3 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAX2Q96IS3 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAX2Q96IS3 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAX2Q96IS3 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAX2Q96IS3 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAX2Q96IS3 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAX2Q96IS3 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAX2Q96IS3 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAX2Q96IS3 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAX2Q96IS3 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAX2Q96IS3 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAX2Q96IS3 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAX2Q96IS3 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAX2Q96IS3 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAX2Q96IS3 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAX2Q96IS3 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAX2Q96IS3 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAX2Q96IS3 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAX2Q96IS3 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAX2Q96IS3 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAX2Q96IS3 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAX2Q96IS3 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAX2Q96IS3 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAX2Q96IS3 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAX2Q96IS3 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAX2Q96IS3 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAX2Q96IS3 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAX2Q96IS3 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAX2Q96IS3 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RAX2Q96IS3 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAX2Q96IS3 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RAX2Q96IS3 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAX2Q96IS3 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAX2Q96IS3 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAX2Q96IS3 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAX2Q96IS3 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RAX2Q96IS3 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAX2Q96IS3 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAX2Q96IS3 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAX2Q96IS3 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAX2Q96IS3 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAX2Q96IS3 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAX2Q96IS3 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAX2Q96IS3 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAX2Q96IS3 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAX2Q96IS3 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAX2Q96IS3 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAX2Q96IS3 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAX2Q96IS3 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAX2Q96IS3 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAX2Q96IS3 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAX2Q96IS3 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAX2Q96IS3 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RAX2Q96IS3 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAX2Q96IS3 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAX2Q96IS3 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAX2Q96IS3 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAX2Q96IS3 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAX2Q96IS3 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAX2Q96IS3 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RAX2Q96IS3 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAX2Q96IS3 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RAX2Q96IS3 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAX2Q96IS3 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAX2Q96IS3 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAX2Q96IS3 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAX2Q96IS3 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAX2Q96IS3 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAX2Q96IS3 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAX2Q96IS3 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAX2Q96IS3 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAX2Q96IS3 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAX2Q96IS3 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAX2Q96IS3 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAX2Q96IS3 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAX2Q96IS3 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAX2Q96IS3 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAX2Q96IS3 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAX2Q96IS3 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAX2Q96IS3 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAX2Q96IS3 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAX2Q96IS3 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAX2Q96IS3 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAX2Q96IS3 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAX2Q96IS3 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RAX2Q96IS3 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RAX2Q96IS3 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAX2Q96IS3 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RAX2Q96IS3 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAX2Q96IS3 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAX2Q96IS3 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAX2Q96IS3 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms