Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWF3

SSMEM1, Serine-rich single-pass membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSMEM1Q8WWF3 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SSMEM1Q8WWF3 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SSMEM1Q8WWF3 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SSMEM1Q8WWF3 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SSMEM1Q8WWF3 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SSMEM1Q8WWF3 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SSMEM1Q8WWF3 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SSMEM1Q8WWF3 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SSMEM1Q8WWF3 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SSMEM1Q8WWF3 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SSMEM1Q8WWF3 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SSMEM1Q8WWF3 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SSMEM1Q8WWF3 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SSMEM1Q8WWF3 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SSMEM1Q8WWF3 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SSMEM1Q8WWF3 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SSMEM1Q8WWF3 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SSMEM1Q8WWF3 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SSMEM1Q8WWF3 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SSMEM1Q8WWF3 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SSMEM1Q8WWF3 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SSMEM1Q8WWF3 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SSMEM1Q8WWF3 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SSMEM1Q8WWF3 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SSMEM1Q8WWF3 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SSMEM1Q8WWF3 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SSMEM1Q8WWF3 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SSMEM1Q8WWF3 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SSMEM1Q8WWF3 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SSMEM1Q8WWF3 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SSMEM1Q8WWF3 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SSMEM1Q8WWF3 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SSMEM1Q8WWF3 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SSMEM1Q8WWF3 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SSMEM1Q8WWF3 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SSMEM1Q8WWF3 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SSMEM1Q8WWF3 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SSMEM1Q8WWF3 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SSMEM1Q8WWF3 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SSMEM1Q8WWF3 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SSMEM1Q8WWF3 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SSMEM1Q8WWF3 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SSMEM1Q8WWF3 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SSMEM1Q8WWF3 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SSMEM1Q8WWF3 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SSMEM1Q8WWF3 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SSMEM1Q8WWF3 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SSMEM1Q8WWF3 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SSMEM1Q8WWF3 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SSMEM1Q8WWF3 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SSMEM1Q8WWF3 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SSMEM1Q8WWF3 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SSMEM1Q8WWF3 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SSMEM1Q8WWF3 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SSMEM1Q8WWF3 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SSMEM1Q8WWF3 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SSMEM1Q8WWF3 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SSMEM1Q8WWF3 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SSMEM1Q8WWF3 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SSMEM1Q8WWF3 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SSMEM1Q8WWF3 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSMEM1Q8WWF3 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSMEM1Q8WWF3 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSMEM1Q8WWF3 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSMEM1Q8WWF3 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSMEM1Q8WWF3 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSMEM1Q8WWF3 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSMEM1Q8WWF3 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSMEM1Q8WWF3 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSMEM1Q8WWF3 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSMEM1Q8WWF3 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSMEM1Q8WWF3 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SSMEM1Q8WWF3 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SSMEM1Q8WWF3 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSMEM1Q8WWF3 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSMEM1Q8WWF3 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSMEM1Q8WWF3 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSMEM1Q8WWF3 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSMEM1Q8WWF3 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSMEM1Q8WWF3 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSMEM1Q8WWF3 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSMEM1Q8WWF3 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SSMEM1Q8WWF3 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SSMEM1Q8WWF3 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SSMEM1Q8WWF3 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SSMEM1Q8WWF3 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SSMEM1Q8WWF3 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SSMEM1Q8WWF3 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SSMEM1Q8WWF3 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SSMEM1Q8WWF3 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SSMEM1Q8WWF3 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SSMEM1Q8WWF3 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SSMEM1Q8WWF3 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SSMEM1Q8WWF3 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SSMEM1Q8WWF3 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SSMEM1Q8WWF3 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SSMEM1Q8WWF3 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SSMEM1Q8WWF3 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SSMEM1Q8WWF3 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SSMEM1Q8WWF3 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms