Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUD2

ERC1, ELKS/Rab6-interacting/CAST family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERC1Q8IUD2 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ERC1Q8IUD2 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ERC1Q8IUD2 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ERC1Q8IUD2 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
ERC1Q8IUD2 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ERC1Q8IUD2 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
ERC1Q8IUD2 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ERC1Q8IUD2 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ERC1Q8IUD2 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ERC1Q8IUD2 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ERC1Q8IUD2 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ERC1Q8IUD2 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ERC1Q8IUD2 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ERC1Q8IUD2 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ERC1Q8IUD2 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ERC1Q8IUD2 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ERC1Q8IUD2 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ERC1Q8IUD2 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ERC1Q8IUD2 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ERC1Q8IUD2 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ERC1Q8IUD2 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ERC1Q8IUD2 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ERC1Q8IUD2 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ERC1Q8IUD2 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ERC1Q8IUD2 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ERC1Q8IUD2 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ERC1Q8IUD2 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ERC1Q8IUD2 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ERC1Q8IUD2 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ERC1Q8IUD2 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ERC1Q8IUD2 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ERC1Q8IUD2 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ERC1Q8IUD2 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ERC1Q8IUD2 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ERC1Q8IUD2 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ERC1Q8IUD2 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ERC1Q8IUD2 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ERC1Q8IUD2 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ERC1Q8IUD2 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ERC1Q8IUD2 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ERC1Q8IUD2 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ERC1Q8IUD2 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ERC1Q8IUD2 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ERC1Q8IUD2 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ERC1Q8IUD2 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ERC1Q8IUD2 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ERC1Q8IUD2 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ERC1Q8IUD2 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ERC1Q8IUD2 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ERC1Q8IUD2 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ERC1Q8IUD2 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ERC1Q8IUD2 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ERC1Q8IUD2 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ERC1Q8IUD2 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ERC1Q8IUD2 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ERC1Q8IUD2 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ERC1Q8IUD2 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
ERC1Q8IUD2 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ERC1Q8IUD2 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ERC1Q8IUD2 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ERC1Q8IUD2 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ERC1Q8IUD2 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ERC1Q8IUD2 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ERC1Q8IUD2 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ERC1Q8IUD2 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ERC1Q8IUD2 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ERC1Q8IUD2 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ERC1Q8IUD2 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ERC1Q8IUD2 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ERC1Q8IUD2 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ERC1Q8IUD2 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ERC1Q8IUD2 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ERC1Q8IUD2 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ERC1Q8IUD2 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ERC1Q8IUD2 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ERC1Q8IUD2 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ERC1Q8IUD2 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ERC1Q8IUD2 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ERC1Q8IUD2 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ERC1Q8IUD2 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ERC1Q8IUD2 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ERC1Q8IUD2 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ERC1Q8IUD2 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ERC1Q8IUD2 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ERC1Q8IUD2 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ERC1Q8IUD2 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ERC1Q8IUD2 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ERC1Q8IUD2 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ERC1Q8IUD2 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ERC1Q8IUD2 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ERC1Q8IUD2 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ERC1Q8IUD2 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ERC1Q8IUD2 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ERC1Q8IUD2 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ERC1Q8IUD2 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ERC1Q8IUD2 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ERC1Q8IUD2 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
ERC1Q8IUD2 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ERC1Q8IUD2 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ERC1Q8IUD2 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms