Protein–RNA interactions for Protein: Q86WV1

SKAP1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP1Q86WV1 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SKAP1Q86WV1 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SKAP1Q86WV1 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SKAP1Q86WV1 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SKAP1Q86WV1 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SKAP1Q86WV1 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SKAP1Q86WV1 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SKAP1Q86WV1 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SKAP1Q86WV1 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SKAP1Q86WV1 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SKAP1Q86WV1 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SKAP1Q86WV1 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SKAP1Q86WV1 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SKAP1Q86WV1 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SKAP1Q86WV1 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SKAP1Q86WV1 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SKAP1Q86WV1 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SKAP1Q86WV1 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SKAP1Q86WV1 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SKAP1Q86WV1 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SKAP1Q86WV1 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SKAP1Q86WV1 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SKAP1Q86WV1 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SKAP1Q86WV1 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SKAP1Q86WV1 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SKAP1Q86WV1 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SKAP1Q86WV1 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SKAP1Q86WV1 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SKAP1Q86WV1 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SKAP1Q86WV1 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SKAP1Q86WV1 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SKAP1Q86WV1 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SKAP1Q86WV1 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SKAP1Q86WV1 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SKAP1Q86WV1 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SKAP1Q86WV1 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SKAP1Q86WV1 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SKAP1Q86WV1 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SKAP1Q86WV1 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SKAP1Q86WV1 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SKAP1Q86WV1 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SKAP1Q86WV1 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SKAP1Q86WV1 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SKAP1Q86WV1 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SKAP1Q86WV1 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SKAP1Q86WV1 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SKAP1Q86WV1 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SKAP1Q86WV1 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SKAP1Q86WV1 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SKAP1Q86WV1 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SKAP1Q86WV1 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SKAP1Q86WV1 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SKAP1Q86WV1 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SKAP1Q86WV1 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SKAP1Q86WV1 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SKAP1Q86WV1 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SKAP1Q86WV1 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SKAP1Q86WV1 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SKAP1Q86WV1 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SKAP1Q86WV1 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SKAP1Q86WV1 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SKAP1Q86WV1 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SKAP1Q86WV1 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SKAP1Q86WV1 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SKAP1Q86WV1 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SKAP1Q86WV1 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SKAP1Q86WV1 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SKAP1Q86WV1 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SKAP1Q86WV1 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SKAP1Q86WV1 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SKAP1Q86WV1 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SKAP1Q86WV1 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SKAP1Q86WV1 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SKAP1Q86WV1 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SKAP1Q86WV1 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SKAP1Q86WV1 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SKAP1Q86WV1 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SKAP1Q86WV1 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.64
SKAP1Q86WV1 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SKAP1Q86WV1 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SKAP1Q86WV1 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SKAP1Q86WV1 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SKAP1Q86WV1 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SKAP1Q86WV1 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SKAP1Q86WV1 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SKAP1Q86WV1 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SKAP1Q86WV1 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SKAP1Q86WV1 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SKAP1Q86WV1 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SKAP1Q86WV1 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SKAP1Q86WV1 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SKAP1Q86WV1 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SKAP1Q86WV1 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SKAP1Q86WV1 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SKAP1Q86WV1 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SKAP1Q86WV1 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SKAP1Q86WV1 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SKAP1Q86WV1 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SKAP1Q86WV1 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SKAP1Q86WV1 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms