Protein–RNA interactions for Protein: Q76N89

HECW1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECW1Q76N89 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC31.72■■■□□ 2.67
HECW1Q76N89 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC31.72■■■□□ 2.67
HECW1Q76N89 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
HECW1Q76N89 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
HECW1Q76N89 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
HECW1Q76N89 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
HECW1Q76N89 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
HECW1Q76N89 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
HECW1Q76N89 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC31.71■■■□□ 2.67
HECW1Q76N89 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.71■■■□□ 2.67
HECW1Q76N89 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.71■■■□□ 2.67
HECW1Q76N89 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
HECW1Q76N89 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
HECW1Q76N89 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
HECW1Q76N89 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC31.71■■■□□ 2.67
HECW1Q76N89 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
HECW1Q76N89 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
HECW1Q76N89 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
HECW1Q76N89 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC31.71■■■□□ 2.67
HECW1Q76N89 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
HECW1Q76N89 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
HECW1Q76N89 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
HECW1Q76N89 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
HECW1Q76N89 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC31.7■■■□□ 2.67
HECW1Q76N89 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
HECW1Q76N89 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
HECW1Q76N89 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
HECW1Q76N89 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
HECW1Q76N89 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC31.7■■■□□ 2.67
HECW1Q76N89 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
HECW1Q76N89 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
HECW1Q76N89 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.66
HECW1Q76N89 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC31.7■■■□□ 2.66
HECW1Q76N89 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
HECW1Q76N89 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
HECW1Q76N89 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
HECW1Q76N89 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
HECW1Q76N89 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
HECW1Q76N89 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
HECW1Q76N89 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
HECW1Q76N89 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
HECW1Q76N89 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
HECW1Q76N89 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC31.69■■■□□ 2.66
HECW1Q76N89 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC31.69■■■□□ 2.66
HECW1Q76N89 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
HECW1Q76N89 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
HECW1Q76N89 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
HECW1Q76N89 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
HECW1Q76N89 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC31.68■■■□□ 2.66
HECW1Q76N89 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
HECW1Q76N89 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
HECW1Q76N89 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
HECW1Q76N89 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
HECW1Q76N89 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
HECW1Q76N89 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
HECW1Q76N89 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
HECW1Q76N89 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
HECW1Q76N89 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
HECW1Q76N89 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
HECW1Q76N89 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
HECW1Q76N89 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
HECW1Q76N89 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
HECW1Q76N89 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
HECW1Q76N89 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
HECW1Q76N89 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
HECW1Q76N89 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
HECW1Q76N89 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
HECW1Q76N89 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
HECW1Q76N89 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
HECW1Q76N89 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
HECW1Q76N89 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
HECW1Q76N89 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
HECW1Q76N89 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
HECW1Q76N89 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
HECW1Q76N89 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
HECW1Q76N89 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
HECW1Q76N89 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC31.66■■■□□ 2.66
HECW1Q76N89 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
HECW1Q76N89 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
HECW1Q76N89 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
HECW1Q76N89 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
HECW1Q76N89 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
HECW1Q76N89 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
HECW1Q76N89 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
HECW1Q76N89 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC31.65■■■□□ 2.66
HECW1Q76N89 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC31.65■■■□□ 2.66
HECW1Q76N89 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
HECW1Q76N89 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
HECW1Q76N89 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
HECW1Q76N89 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
HECW1Q76N89 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
HECW1Q76N89 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
HECW1Q76N89 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
HECW1Q76N89 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
HECW1Q76N89 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
HECW1Q76N89 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC31.64■■■□□ 2.66
HECW1Q76N89 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
HECW1Q76N89 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
HECW1Q76N89 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
HECW1Q76N89 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms