Protein–RNA interactions for Protein: Q6NYC8

PPP1R18, Phostensin, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R18Q6NYC8 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PPP1R18Q6NYC8 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PPP1R18Q6NYC8 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PPP1R18Q6NYC8 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PPP1R18Q6NYC8 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PPP1R18Q6NYC8 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PPP1R18Q6NYC8 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PPP1R18Q6NYC8 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PPP1R18Q6NYC8 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PPP1R18Q6NYC8 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PPP1R18Q6NYC8 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PPP1R18Q6NYC8 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PPP1R18Q6NYC8 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PPP1R18Q6NYC8 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PPP1R18Q6NYC8 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PPP1R18Q6NYC8 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PPP1R18Q6NYC8 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PPP1R18Q6NYC8 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PPP1R18Q6NYC8 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PPP1R18Q6NYC8 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PPP1R18Q6NYC8 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PPP1R18Q6NYC8 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PPP1R18Q6NYC8 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PPP1R18Q6NYC8 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PPP1R18Q6NYC8 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PPP1R18Q6NYC8 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPP1R18Q6NYC8 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPP1R18Q6NYC8 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPP1R18Q6NYC8 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPP1R18Q6NYC8 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPP1R18Q6NYC8 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPP1R18Q6NYC8 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPP1R18Q6NYC8 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPP1R18Q6NYC8 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPP1R18Q6NYC8 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPP1R18Q6NYC8 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PPP1R18Q6NYC8 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPP1R18Q6NYC8 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPP1R18Q6NYC8 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPP1R18Q6NYC8 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPP1R18Q6NYC8 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPP1R18Q6NYC8 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPP1R18Q6NYC8 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPP1R18Q6NYC8 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPP1R18Q6NYC8 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPP1R18Q6NYC8 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPP1R18Q6NYC8 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPP1R18Q6NYC8 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPP1R18Q6NYC8 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PPP1R18Q6NYC8 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPP1R18Q6NYC8 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPP1R18Q6NYC8 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PPP1R18Q6NYC8 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPP1R18Q6NYC8 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPP1R18Q6NYC8 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPP1R18Q6NYC8 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPP1R18Q6NYC8 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPP1R18Q6NYC8 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPP1R18Q6NYC8 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPP1R18Q6NYC8 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPP1R18Q6NYC8 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPP1R18Q6NYC8 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPP1R18Q6NYC8 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPP1R18Q6NYC8 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPP1R18Q6NYC8 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPP1R18Q6NYC8 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPP1R18Q6NYC8 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPP1R18Q6NYC8 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPP1R18Q6NYC8 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPP1R18Q6NYC8 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPP1R18Q6NYC8 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPP1R18Q6NYC8 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPP1R18Q6NYC8 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PPP1R18Q6NYC8 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPP1R18Q6NYC8 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPP1R18Q6NYC8 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPP1R18Q6NYC8 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPP1R18Q6NYC8 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPP1R18Q6NYC8 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPP1R18Q6NYC8 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPP1R18Q6NYC8 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPP1R18Q6NYC8 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPP1R18Q6NYC8 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPP1R18Q6NYC8 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPP1R18Q6NYC8 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPP1R18Q6NYC8 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPP1R18Q6NYC8 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPP1R18Q6NYC8 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPP1R18Q6NYC8 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPP1R18Q6NYC8 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPP1R18Q6NYC8 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PPP1R18Q6NYC8 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPP1R18Q6NYC8 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPP1R18Q6NYC8 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPP1R18Q6NYC8 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPP1R18Q6NYC8 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPP1R18Q6NYC8 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPP1R18Q6NYC8 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPP1R18Q6NYC8 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPP1R18Q6NYC8 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms