Protein–RNA interactions for Protein: Q6NWY9

PRPF40B, Pre-mRNA-processing factor 40 homolog B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40BQ6NWY9 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRPF40BQ6NWY9 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRPF40BQ6NWY9 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRPF40BQ6NWY9 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRPF40BQ6NWY9 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRPF40BQ6NWY9 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRPF40BQ6NWY9 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRPF40BQ6NWY9 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRPF40BQ6NWY9 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRPF40BQ6NWY9 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRPF40BQ6NWY9 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PRPF40BQ6NWY9 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRPF40BQ6NWY9 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRPF40BQ6NWY9 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRPF40BQ6NWY9 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRPF40BQ6NWY9 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PRPF40BQ6NWY9 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRPF40BQ6NWY9 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRPF40BQ6NWY9 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRPF40BQ6NWY9 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRPF40BQ6NWY9 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRPF40BQ6NWY9 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRPF40BQ6NWY9 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRPF40BQ6NWY9 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRPF40BQ6NWY9 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRPF40BQ6NWY9 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRPF40BQ6NWY9 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRPF40BQ6NWY9 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRPF40BQ6NWY9 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRPF40BQ6NWY9 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRPF40BQ6NWY9 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRPF40BQ6NWY9 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRPF40BQ6NWY9 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRPF40BQ6NWY9 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRPF40BQ6NWY9 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PRPF40BQ6NWY9 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRPF40BQ6NWY9 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRPF40BQ6NWY9 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRPF40BQ6NWY9 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRPF40BQ6NWY9 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRPF40BQ6NWY9 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRPF40BQ6NWY9 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRPF40BQ6NWY9 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRPF40BQ6NWY9 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
PRPF40BQ6NWY9 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRPF40BQ6NWY9 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRPF40BQ6NWY9 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRPF40BQ6NWY9 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRPF40BQ6NWY9 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRPF40BQ6NWY9 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRPF40BQ6NWY9 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRPF40BQ6NWY9 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRPF40BQ6NWY9 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRPF40BQ6NWY9 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRPF40BQ6NWY9 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRPF40BQ6NWY9 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRPF40BQ6NWY9 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRPF40BQ6NWY9 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRPF40BQ6NWY9 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PRPF40BQ6NWY9 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRPF40BQ6NWY9 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRPF40BQ6NWY9 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRPF40BQ6NWY9 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRPF40BQ6NWY9 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRPF40BQ6NWY9 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRPF40BQ6NWY9 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRPF40BQ6NWY9 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRPF40BQ6NWY9 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRPF40BQ6NWY9 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRPF40BQ6NWY9 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRPF40BQ6NWY9 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRPF40BQ6NWY9 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRPF40BQ6NWY9 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRPF40BQ6NWY9 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRPF40BQ6NWY9 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRPF40BQ6NWY9 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRPF40BQ6NWY9 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRPF40BQ6NWY9 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PRPF40BQ6NWY9 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRPF40BQ6NWY9 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRPF40BQ6NWY9 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRPF40BQ6NWY9 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRPF40BQ6NWY9 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRPF40BQ6NWY9 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRPF40BQ6NWY9 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRPF40BQ6NWY9 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRPF40BQ6NWY9 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRPF40BQ6NWY9 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRPF40BQ6NWY9 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRPF40BQ6NWY9 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRPF40BQ6NWY9 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRPF40BQ6NWY9 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRPF40BQ6NWY9 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PRPF40BQ6NWY9 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRPF40BQ6NWY9 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRPF40BQ6NWY9 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRPF40BQ6NWY9 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRPF40BQ6NWY9 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRPF40BQ6NWY9 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRPF40BQ6NWY9 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms