Protein–RNA interactions for Protein: Q6DD88

ATL3, Atlastin-3, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL3Q6DD88 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATL3Q6DD88 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATL3Q6DD88 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATL3Q6DD88 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ATL3Q6DD88 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ATL3Q6DD88 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ATL3Q6DD88 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ATL3Q6DD88 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ATL3Q6DD88 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATL3Q6DD88 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATL3Q6DD88 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATL3Q6DD88 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ATL3Q6DD88 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ATL3Q6DD88 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATL3Q6DD88 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATL3Q6DD88 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATL3Q6DD88 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATL3Q6DD88 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATL3Q6DD88 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATL3Q6DD88 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATL3Q6DD88 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATL3Q6DD88 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATL3Q6DD88 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATL3Q6DD88 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATL3Q6DD88 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATL3Q6DD88 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATL3Q6DD88 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATL3Q6DD88 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATL3Q6DD88 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATL3Q6DD88 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATL3Q6DD88 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATL3Q6DD88 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATL3Q6DD88 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATL3Q6DD88 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATL3Q6DD88 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATL3Q6DD88 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATL3Q6DD88 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATL3Q6DD88 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATL3Q6DD88 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATL3Q6DD88 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATL3Q6DD88 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ATL3Q6DD88 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATL3Q6DD88 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATL3Q6DD88 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATL3Q6DD88 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ATL3Q6DD88 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATL3Q6DD88 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATL3Q6DD88 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATL3Q6DD88 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATL3Q6DD88 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATL3Q6DD88 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATL3Q6DD88 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATL3Q6DD88 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATL3Q6DD88 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATL3Q6DD88 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATL3Q6DD88 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATL3Q6DD88 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATL3Q6DD88 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATL3Q6DD88 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATL3Q6DD88 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATL3Q6DD88 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATL3Q6DD88 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATL3Q6DD88 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ATL3Q6DD88 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATL3Q6DD88 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATL3Q6DD88 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATL3Q6DD88 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATL3Q6DD88 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATL3Q6DD88 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATL3Q6DD88 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATL3Q6DD88 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ATL3Q6DD88 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATL3Q6DD88 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATL3Q6DD88 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATL3Q6DD88 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATL3Q6DD88 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATL3Q6DD88 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATL3Q6DD88 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATL3Q6DD88 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATL3Q6DD88 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATL3Q6DD88 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATL3Q6DD88 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATL3Q6DD88 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATL3Q6DD88 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATL3Q6DD88 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATL3Q6DD88 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATL3Q6DD88 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATL3Q6DD88 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATL3Q6DD88 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATL3Q6DD88 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATL3Q6DD88 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATL3Q6DD88 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATL3Q6DD88 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATL3Q6DD88 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATL3Q6DD88 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATL3Q6DD88 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATL3Q6DD88 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATL3Q6DD88 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATL3Q6DD88 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATL3Q6DD88 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms