Protein–RNA interactions for Protein: Q53FE4

C4orf17, Uncharacterized protein C4orf17, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf17Q53FE4 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C4orf17Q53FE4 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C4orf17Q53FE4 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C4orf17Q53FE4 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C4orf17Q53FE4 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
C4orf17Q53FE4 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C4orf17Q53FE4 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C4orf17Q53FE4 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C4orf17Q53FE4 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C4orf17Q53FE4 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C4orf17Q53FE4 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C4orf17Q53FE4 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
C4orf17Q53FE4 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C4orf17Q53FE4 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C4orf17Q53FE4 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C4orf17Q53FE4 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C4orf17Q53FE4 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C4orf17Q53FE4 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C4orf17Q53FE4 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C4orf17Q53FE4 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C4orf17Q53FE4 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C4orf17Q53FE4 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C4orf17Q53FE4 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C4orf17Q53FE4 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C4orf17Q53FE4 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C4orf17Q53FE4 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C4orf17Q53FE4 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C4orf17Q53FE4 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C4orf17Q53FE4 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C4orf17Q53FE4 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C4orf17Q53FE4 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C4orf17Q53FE4 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C4orf17Q53FE4 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C4orf17Q53FE4 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
C4orf17Q53FE4 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C4orf17Q53FE4 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C4orf17Q53FE4 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C4orf17Q53FE4 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C4orf17Q53FE4 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C4orf17Q53FE4 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C4orf17Q53FE4 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C4orf17Q53FE4 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C4orf17Q53FE4 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C4orf17Q53FE4 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C4orf17Q53FE4 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C4orf17Q53FE4 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C4orf17Q53FE4 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
C4orf17Q53FE4 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
C4orf17Q53FE4 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C4orf17Q53FE4 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C4orf17Q53FE4 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C4orf17Q53FE4 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C4orf17Q53FE4 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C4orf17Q53FE4 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
C4orf17Q53FE4 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C4orf17Q53FE4 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C4orf17Q53FE4 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C4orf17Q53FE4 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C4orf17Q53FE4 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C4orf17Q53FE4 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C4orf17Q53FE4 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C4orf17Q53FE4 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C4orf17Q53FE4 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C4orf17Q53FE4 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C4orf17Q53FE4 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C4orf17Q53FE4 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C4orf17Q53FE4 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C4orf17Q53FE4 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C4orf17Q53FE4 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C4orf17Q53FE4 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C4orf17Q53FE4 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C4orf17Q53FE4 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C4orf17Q53FE4 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C4orf17Q53FE4 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C4orf17Q53FE4 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
C4orf17Q53FE4 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C4orf17Q53FE4 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C4orf17Q53FE4 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C4orf17Q53FE4 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C4orf17Q53FE4 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C4orf17Q53FE4 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C4orf17Q53FE4 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C4orf17Q53FE4 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C4orf17Q53FE4 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C4orf17Q53FE4 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C4orf17Q53FE4 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C4orf17Q53FE4 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C4orf17Q53FE4 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C4orf17Q53FE4 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C4orf17Q53FE4 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C4orf17Q53FE4 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C4orf17Q53FE4 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C4orf17Q53FE4 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C4orf17Q53FE4 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
C4orf17Q53FE4 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C4orf17Q53FE4 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C4orf17Q53FE4 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C4orf17Q53FE4 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C4orf17Q53FE4 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
C4orf17Q53FE4 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms