Protein–RNA interactions for Protein: Q3UTD9

Smim15, Small integral membrane protein 15, mousemouse

Predictions only

Length 74 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim15Q3UTD9 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim15Q3UTD9 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim15Q3UTD9 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim15Q3UTD9 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim15Q3UTD9 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smim15Q3UTD9 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smim15Q3UTD9 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smim15Q3UTD9 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smim15Q3UTD9 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smim15Q3UTD9 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smim15Q3UTD9 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smim15Q3UTD9 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Smim15Q3UTD9 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smim15Q3UTD9 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smim15Q3UTD9 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smim15Q3UTD9 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smim15Q3UTD9 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smim15Q3UTD9 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smim15Q3UTD9 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smim15Q3UTD9 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smim15Q3UTD9 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smim15Q3UTD9 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smim15Q3UTD9 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim15Q3UTD9 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim15Q3UTD9 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim15Q3UTD9 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim15Q3UTD9 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim15Q3UTD9 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim15Q3UTD9 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim15Q3UTD9 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim15Q3UTD9 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim15Q3UTD9 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim15Q3UTD9 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim15Q3UTD9 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim15Q3UTD9 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim15Q3UTD9 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim15Q3UTD9 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim15Q3UTD9 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim15Q3UTD9 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim15Q3UTD9 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim15Q3UTD9 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim15Q3UTD9 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim15Q3UTD9 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim15Q3UTD9 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim15Q3UTD9 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim15Q3UTD9 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim15Q3UTD9 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim15Q3UTD9 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim15Q3UTD9 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim15Q3UTD9 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim15Q3UTD9 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim15Q3UTD9 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim15Q3UTD9 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim15Q3UTD9 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim15Q3UTD9 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim15Q3UTD9 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Smim15Q3UTD9 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Smim15Q3UTD9 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Smim15Q3UTD9 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Smim15Q3UTD9 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Smim15Q3UTD9 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Smim15Q3UTD9 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Smim15Q3UTD9 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smim15Q3UTD9 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smim15Q3UTD9 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smim15Q3UTD9 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smim15Q3UTD9 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smim15Q3UTD9 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smim15Q3UTD9 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smim15Q3UTD9 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smim15Q3UTD9 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smim15Q3UTD9 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smim15Q3UTD9 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smim15Q3UTD9 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smim15Q3UTD9 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smim15Q3UTD9 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smim15Q3UTD9 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smim15Q3UTD9 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smim15Q3UTD9 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smim15Q3UTD9 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smim15Q3UTD9 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smim15Q3UTD9 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smim15Q3UTD9 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smim15Q3UTD9 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smim15Q3UTD9 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smim15Q3UTD9 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smim15Q3UTD9 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smim15Q3UTD9 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smim15Q3UTD9 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smim15Q3UTD9 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smim15Q3UTD9 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smim15Q3UTD9 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smim15Q3UTD9 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smim15Q3UTD9 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smim15Q3UTD9 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smim15Q3UTD9 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smim15Q3UTD9 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smim15Q3UTD9 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smim15Q3UTD9 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smim15Q3UTD9 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms