Protein–RNA interactions for Protein: Q2QD12

RPEL1, Ribulose-phosphate 3-epimerase-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPEL1Q2QD12 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPEL1Q2QD12 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPEL1Q2QD12 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPEL1Q2QD12 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPEL1Q2QD12 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RPEL1Q2QD12 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPEL1Q2QD12 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPEL1Q2QD12 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPEL1Q2QD12 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPEL1Q2QD12 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPEL1Q2QD12 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPEL1Q2QD12 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPEL1Q2QD12 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPEL1Q2QD12 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPEL1Q2QD12 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPEL1Q2QD12 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPEL1Q2QD12 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPEL1Q2QD12 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPEL1Q2QD12 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RPEL1Q2QD12 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPEL1Q2QD12 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPEL1Q2QD12 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPEL1Q2QD12 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPEL1Q2QD12 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPEL1Q2QD12 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPEL1Q2QD12 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPEL1Q2QD12 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPEL1Q2QD12 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPEL1Q2QD12 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPEL1Q2QD12 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPEL1Q2QD12 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPEL1Q2QD12 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPEL1Q2QD12 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPEL1Q2QD12 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPEL1Q2QD12 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RPEL1Q2QD12 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPEL1Q2QD12 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPEL1Q2QD12 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPEL1Q2QD12 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPEL1Q2QD12 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPEL1Q2QD12 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPEL1Q2QD12 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RPEL1Q2QD12 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPEL1Q2QD12 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPEL1Q2QD12 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPEL1Q2QD12 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPEL1Q2QD12 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPEL1Q2QD12 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPEL1Q2QD12 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPEL1Q2QD12 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPEL1Q2QD12 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPEL1Q2QD12 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPEL1Q2QD12 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPEL1Q2QD12 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPEL1Q2QD12 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPEL1Q2QD12 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPEL1Q2QD12 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPEL1Q2QD12 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPEL1Q2QD12 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPEL1Q2QD12 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPEL1Q2QD12 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPEL1Q2QD12 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPEL1Q2QD12 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPEL1Q2QD12 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPEL1Q2QD12 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPEL1Q2QD12 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPEL1Q2QD12 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPEL1Q2QD12 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPEL1Q2QD12 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPEL1Q2QD12 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPEL1Q2QD12 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPEL1Q2QD12 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPEL1Q2QD12 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPEL1Q2QD12 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPEL1Q2QD12 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPEL1Q2QD12 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPEL1Q2QD12 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPEL1Q2QD12 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPEL1Q2QD12 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPEL1Q2QD12 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPEL1Q2QD12 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPEL1Q2QD12 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPEL1Q2QD12 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPEL1Q2QD12 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPEL1Q2QD12 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPEL1Q2QD12 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RPEL1Q2QD12 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPEL1Q2QD12 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPEL1Q2QD12 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPEL1Q2QD12 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPEL1Q2QD12 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPEL1Q2QD12 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPEL1Q2QD12 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPEL1Q2QD12 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RPEL1Q2QD12 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPEL1Q2QD12 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPEL1Q2QD12 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPEL1Q2QD12 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPEL1Q2QD12 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPEL1Q2QD12 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms