Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHRNA6Q15825 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHRNA6Q15825 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CHRNA6Q15825 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHRNA6Q15825 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHRNA6Q15825 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHRNA6Q15825 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CHRNA6Q15825 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHRNA6Q15825 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHRNA6Q15825 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CHRNA6Q15825 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CHRNA6Q15825 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHRNA6Q15825 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHRNA6Q15825 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHRNA6Q15825 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHRNA6Q15825 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHRNA6Q15825 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHRNA6Q15825 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHRNA6Q15825 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHRNA6Q15825 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHRNA6Q15825 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHRNA6Q15825 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHRNA6Q15825 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHRNA6Q15825 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHRNA6Q15825 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHRNA6Q15825 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHRNA6Q15825 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHRNA6Q15825 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHRNA6Q15825 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHRNA6Q15825 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHRNA6Q15825 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHRNA6Q15825 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHRNA6Q15825 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHRNA6Q15825 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CHRNA6Q15825 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHRNA6Q15825 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHRNA6Q15825 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHRNA6Q15825 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHRNA6Q15825 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHRNA6Q15825 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHRNA6Q15825 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHRNA6Q15825 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHRNA6Q15825 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHRNA6Q15825 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHRNA6Q15825 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHRNA6Q15825 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHRNA6Q15825 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CHRNA6Q15825 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHRNA6Q15825 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CHRNA6Q15825 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHRNA6Q15825 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHRNA6Q15825 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHRNA6Q15825 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHRNA6Q15825 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHRNA6Q15825 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHRNA6Q15825 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHRNA6Q15825 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHRNA6Q15825 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHRNA6Q15825 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHRNA6Q15825 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHRNA6Q15825 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHRNA6Q15825 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHRNA6Q15825 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHRNA6Q15825 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHRNA6Q15825 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHRNA6Q15825 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHRNA6Q15825 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHRNA6Q15825 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHRNA6Q15825 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHRNA6Q15825 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHRNA6Q15825 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHRNA6Q15825 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHRNA6Q15825 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHRNA6Q15825 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHRNA6Q15825 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHRNA6Q15825 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHRNA6Q15825 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHRNA6Q15825 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHRNA6Q15825 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHRNA6Q15825 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHRNA6Q15825 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHRNA6Q15825 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHRNA6Q15825 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHRNA6Q15825 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHRNA6Q15825 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHRNA6Q15825 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHRNA6Q15825 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHRNA6Q15825 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHRNA6Q15825 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CHRNA6Q15825 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHRNA6Q15825 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHRNA6Q15825 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHRNA6Q15825 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHRNA6Q15825 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CHRNA6Q15825 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHRNA6Q15825 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHRNA6Q15825 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHRNA6Q15825 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHRNA6Q15825 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CHRNA6Q15825 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms