Protein–RNA interactions for Protein: Q15270

NKX1-1, NK1 transcription factor-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-1Q15270 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NKX1-1Q15270 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
NKX1-1Q15270 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NKX1-1Q15270 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NKX1-1Q15270 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NKX1-1Q15270 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NKX1-1Q15270 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NKX1-1Q15270 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NKX1-1Q15270 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NKX1-1Q15270 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NKX1-1Q15270 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NKX1-1Q15270 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NKX1-1Q15270 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NKX1-1Q15270 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NKX1-1Q15270 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
NKX1-1Q15270 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NKX1-1Q15270 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NKX1-1Q15270 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NKX1-1Q15270 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NKX1-1Q15270 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NKX1-1Q15270 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NKX1-1Q15270 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NKX1-1Q15270 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NKX1-1Q15270 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NKX1-1Q15270 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NKX1-1Q15270 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
NKX1-1Q15270 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NKX1-1Q15270 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NKX1-1Q15270 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NKX1-1Q15270 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NKX1-1Q15270 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NKX1-1Q15270 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NKX1-1Q15270 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NKX1-1Q15270 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NKX1-1Q15270 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NKX1-1Q15270 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NKX1-1Q15270 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NKX1-1Q15270 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NKX1-1Q15270 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NKX1-1Q15270 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NKX1-1Q15270 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NKX1-1Q15270 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NKX1-1Q15270 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NKX1-1Q15270 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NKX1-1Q15270 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NKX1-1Q15270 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NKX1-1Q15270 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NKX1-1Q15270 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NKX1-1Q15270 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NKX1-1Q15270 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NKX1-1Q15270 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NKX1-1Q15270 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NKX1-1Q15270 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NKX1-1Q15270 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NKX1-1Q15270 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NKX1-1Q15270 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
NKX1-1Q15270 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NKX1-1Q15270 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NKX1-1Q15270 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
NKX1-1Q15270 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NKX1-1Q15270 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NKX1-1Q15270 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NKX1-1Q15270 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NKX1-1Q15270 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NKX1-1Q15270 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NKX1-1Q15270 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NKX1-1Q15270 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
NKX1-1Q15270 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NKX1-1Q15270 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NKX1-1Q15270 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NKX1-1Q15270 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
NKX1-1Q15270 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NKX1-1Q15270 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NKX1-1Q15270 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NKX1-1Q15270 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NKX1-1Q15270 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NKX1-1Q15270 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NKX1-1Q15270 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NKX1-1Q15270 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NKX1-1Q15270 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NKX1-1Q15270 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
NKX1-1Q15270 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NKX1-1Q15270 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NKX1-1Q15270 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NKX1-1Q15270 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NKX1-1Q15270 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NKX1-1Q15270 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NKX1-1Q15270 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NKX1-1Q15270 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NKX1-1Q15270 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NKX1-1Q15270 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NKX1-1Q15270 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NKX1-1Q15270 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NKX1-1Q15270 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NKX1-1Q15270 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NKX1-1Q15270 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NKX1-1Q15270 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NKX1-1Q15270 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
NKX1-1Q15270 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NKX1-1Q15270 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
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