Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RUNX3Q13761 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RUNX3Q13761 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RUNX3Q13761 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RUNX3Q13761 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RUNX3Q13761 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RUNX3Q13761 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RUNX3Q13761 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RUNX3Q13761 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RUNX3Q13761 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RUNX3Q13761 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RUNX3Q13761 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RUNX3Q13761 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RUNX3Q13761 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RUNX3Q13761 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RUNX3Q13761 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RUNX3Q13761 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RUNX3Q13761 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RUNX3Q13761 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RUNX3Q13761 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RUNX3Q13761 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RUNX3Q13761 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RUNX3Q13761 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RUNX3Q13761 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
RUNX3Q13761 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RUNX3Q13761 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RUNX3Q13761 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RUNX3Q13761 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RUNX3Q13761 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RUNX3Q13761 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RUNX3Q13761 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RUNX3Q13761 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RUNX3Q13761 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RUNX3Q13761 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
RUNX3Q13761 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RUNX3Q13761 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RUNX3Q13761 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RUNX3Q13761 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RUNX3Q13761 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RUNX3Q13761 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RUNX3Q13761 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RUNX3Q13761 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RUNX3Q13761 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RUNX3Q13761 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RUNX3Q13761 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
RUNX3Q13761 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
RUNX3Q13761 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RUNX3Q13761 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
RUNX3Q13761 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
RUNX3Q13761 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
RUNX3Q13761 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
RUNX3Q13761 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
RUNX3Q13761 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RUNX3Q13761 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
RUNX3Q13761 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RUNX3Q13761 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
RUNX3Q13761 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RUNX3Q13761 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
RUNX3Q13761 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
RUNX3Q13761 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RUNX3Q13761 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RUNX3Q13761 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RUNX3Q13761 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RUNX3Q13761 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RUNX3Q13761 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RUNX3Q13761 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
RUNX3Q13761 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RUNX3Q13761 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RUNX3Q13761 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RUNX3Q13761 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
RUNX3Q13761 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
RUNX3Q13761 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
RUNX3Q13761 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
RUNX3Q13761 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
RUNX3Q13761 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
RUNX3Q13761 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
RUNX3Q13761 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
RUNX3Q13761 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
RUNX3Q13761 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RUNX3Q13761 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RUNX3Q13761 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RUNX3Q13761 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RUNX3Q13761 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
RUNX3Q13761 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
RUNX3Q13761 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RUNX3Q13761 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RUNX3Q13761 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RUNX3Q13761 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RUNX3Q13761 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RUNX3Q13761 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RUNX3Q13761 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RUNX3Q13761 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RUNX3Q13761 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RUNX3Q13761 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
RUNX3Q13761 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
RUNX3Q13761 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
RUNX3Q13761 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
RUNX3Q13761 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
RUNX3Q13761 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
RUNX3Q13761 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
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