Protein–RNA interactions for Protein: Q13421

MSLN, Mesothelin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNQ13421 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MSLNQ13421 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MSLNQ13421 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MSLNQ13421 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
MSLNQ13421 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
MSLNQ13421 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
MSLNQ13421 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MSLNQ13421 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MSLNQ13421 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MSLNQ13421 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MSLNQ13421 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MSLNQ13421 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MSLNQ13421 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MSLNQ13421 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MSLNQ13421 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MSLNQ13421 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MSLNQ13421 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MSLNQ13421 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MSLNQ13421 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MSLNQ13421 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MSLNQ13421 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MSLNQ13421 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
MSLNQ13421 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MSLNQ13421 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MSLNQ13421 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MSLNQ13421 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MSLNQ13421 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MSLNQ13421 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MSLNQ13421 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MSLNQ13421 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MSLNQ13421 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MSLNQ13421 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MSLNQ13421 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MSLNQ13421 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MSLNQ13421 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MSLNQ13421 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MSLNQ13421 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MSLNQ13421 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MSLNQ13421 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MSLNQ13421 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MSLNQ13421 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MSLNQ13421 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MSLNQ13421 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MSLNQ13421 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MSLNQ13421 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MSLNQ13421 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MSLNQ13421 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MSLNQ13421 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MSLNQ13421 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
MSLNQ13421 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MSLNQ13421 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MSLNQ13421 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MSLNQ13421 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MSLNQ13421 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MSLNQ13421 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MSLNQ13421 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MSLNQ13421 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MSLNQ13421 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MSLNQ13421 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MSLNQ13421 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MSLNQ13421 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MSLNQ13421 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MSLNQ13421 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MSLNQ13421 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MSLNQ13421 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MSLNQ13421 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MSLNQ13421 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MSLNQ13421 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MSLNQ13421 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MSLNQ13421 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MSLNQ13421 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
MSLNQ13421 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MSLNQ13421 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MSLNQ13421 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
MSLNQ13421 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MSLNQ13421 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MSLNQ13421 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MSLNQ13421 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
MSLNQ13421 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MSLNQ13421 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MSLNQ13421 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MSLNQ13421 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MSLNQ13421 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
MSLNQ13421 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MSLNQ13421 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MSLNQ13421 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MSLNQ13421 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MSLNQ13421 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MSLNQ13421 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MSLNQ13421 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MSLNQ13421 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MSLNQ13421 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MSLNQ13421 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MSLNQ13421 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MSLNQ13421 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MSLNQ13421 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MSLNQ13421 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MSLNQ13421 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MSLNQ13421 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MSLNQ13421 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
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