Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

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Length 1,112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PDE3BQ13370 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PDE3BQ13370 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PDE3BQ13370 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PDE3BQ13370 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PDE3BQ13370 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PDE3BQ13370 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PDE3BQ13370 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PDE3BQ13370 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PDE3BQ13370 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PDE3BQ13370 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PDE3BQ13370 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PDE3BQ13370 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PDE3BQ13370 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PDE3BQ13370 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PDE3BQ13370 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PDE3BQ13370 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PDE3BQ13370 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PDE3BQ13370 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PDE3BQ13370 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PDE3BQ13370 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PDE3BQ13370 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.01
PDE3BQ13370 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PDE3BQ13370 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
PDE3BQ13370 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PDE3BQ13370 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PDE3BQ13370 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PDE3BQ13370 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PDE3BQ13370 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PDE3BQ13370 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PDE3BQ13370 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PDE3BQ13370 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
PDE3BQ13370 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PDE3BQ13370 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PDE3BQ13370 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PDE3BQ13370 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PDE3BQ13370 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PDE3BQ13370 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PDE3BQ13370 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PDE3BQ13370 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PDE3BQ13370 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PDE3BQ13370 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PDE3BQ13370 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PDE3BQ13370 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PDE3BQ13370 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PDE3BQ13370 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PDE3BQ13370 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PDE3BQ13370 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PDE3BQ13370 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PDE3BQ13370 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PDE3BQ13370 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PDE3BQ13370 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PDE3BQ13370 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PDE3BQ13370 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PDE3BQ13370 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PDE3BQ13370 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PDE3BQ13370 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PDE3BQ13370 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PDE3BQ13370 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PDE3BQ13370 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PDE3BQ13370 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PDE3BQ13370 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PDE3BQ13370 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PDE3BQ13370 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PDE3BQ13370 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PDE3BQ13370 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
PDE3BQ13370 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
PDE3BQ13370 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PDE3BQ13370 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PDE3BQ13370 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PDE3BQ13370 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PDE3BQ13370 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PDE3BQ13370 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PDE3BQ13370 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PDE3BQ13370 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PDE3BQ13370 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PDE3BQ13370 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PDE3BQ13370 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PDE3BQ13370 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PDE3BQ13370 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PDE3BQ13370 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PDE3BQ13370 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
PDE3BQ13370 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PDE3BQ13370 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PDE3BQ13370 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PDE3BQ13370 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PDE3BQ13370 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PDE3BQ13370 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PDE3BQ13370 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PDE3BQ13370 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PDE3BQ13370 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PDE3BQ13370 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PDE3BQ13370 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
PDE3BQ13370 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PDE3BQ13370 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PDE3BQ13370 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
PDE3BQ13370 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PDE3BQ13370 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PDE3BQ13370 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PDE3BQ13370 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
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