Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

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Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BPTFQ12830 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BPTFQ12830 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BPTFQ12830 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BPTFQ12830 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BPTFQ12830 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BPTFQ12830 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BPTFQ12830 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BPTFQ12830 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BPTFQ12830 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BPTFQ12830 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
BPTFQ12830 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BPTFQ12830 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BPTFQ12830 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BPTFQ12830 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BPTFQ12830 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BPTFQ12830 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BPTFQ12830 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BPTFQ12830 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BPTFQ12830 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BPTFQ12830 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BPTFQ12830 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BPTFQ12830 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BPTFQ12830 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BPTFQ12830 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BPTFQ12830 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BPTFQ12830 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BPTFQ12830 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BPTFQ12830 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BPTFQ12830 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BPTFQ12830 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BPTFQ12830 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BPTFQ12830 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BPTFQ12830 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
BPTFQ12830 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
BPTFQ12830 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BPTFQ12830 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BPTFQ12830 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BPTFQ12830 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BPTFQ12830 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BPTFQ12830 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BPTFQ12830 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
BPTFQ12830 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BPTFQ12830 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BPTFQ12830 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BPTFQ12830 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BPTFQ12830 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BPTFQ12830 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BPTFQ12830 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BPTFQ12830 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BPTFQ12830 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BPTFQ12830 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BPTFQ12830 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BPTFQ12830 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BPTFQ12830 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BPTFQ12830 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BPTFQ12830 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BPTFQ12830 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BPTFQ12830 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BPTFQ12830 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
BPTFQ12830 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
BPTFQ12830 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BPTFQ12830 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BPTFQ12830 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BPTFQ12830 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
BPTFQ12830 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BPTFQ12830 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BPTFQ12830 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
BPTFQ12830 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BPTFQ12830 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BPTFQ12830 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
BPTFQ12830 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BPTFQ12830 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BPTFQ12830 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BPTFQ12830 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BPTFQ12830 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BPTFQ12830 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BPTFQ12830 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BPTFQ12830 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BPTFQ12830 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BPTFQ12830 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BPTFQ12830 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BPTFQ12830 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BPTFQ12830 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BPTFQ12830 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BPTFQ12830 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
BPTFQ12830 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BPTFQ12830 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BPTFQ12830 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
BPTFQ12830 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
BPTFQ12830 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
BPTFQ12830 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
BPTFQ12830 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
BPTFQ12830 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
BPTFQ12830 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
BPTFQ12830 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
BPTFQ12830 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
BPTFQ12830 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
BPTFQ12830 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
BPTFQ12830 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
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