Protein–RNA interactions for Protein: Q03350

Thbs2, Thrombospondin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs2Q03350 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Thbs2Q03350 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Thbs2Q03350 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Thbs2Q03350 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Thbs2Q03350 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Thbs2Q03350 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Thbs2Q03350 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Thbs2Q03350 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Thbs2Q03350 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Thbs2Q03350 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Thbs2Q03350 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Thbs2Q03350 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Thbs2Q03350 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Thbs2Q03350 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Thbs2Q03350 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Thbs2Q03350 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Thbs2Q03350 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Thbs2Q03350 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Thbs2Q03350 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Thbs2Q03350 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Thbs2Q03350 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Thbs2Q03350 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Thbs2Q03350 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Thbs2Q03350 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Thbs2Q03350 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Thbs2Q03350 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Thbs2Q03350 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Thbs2Q03350 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Thbs2Q03350 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Thbs2Q03350 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Thbs2Q03350 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Thbs2Q03350 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Thbs2Q03350 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Thbs2Q03350 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Thbs2Q03350 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Thbs2Q03350 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Thbs2Q03350 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Thbs2Q03350 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Thbs2Q03350 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Thbs2Q03350 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Thbs2Q03350 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Thbs2Q03350 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Thbs2Q03350 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Thbs2Q03350 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Thbs2Q03350 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Thbs2Q03350 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Thbs2Q03350 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Thbs2Q03350 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Thbs2Q03350 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Thbs2Q03350 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Thbs2Q03350 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Thbs2Q03350 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Thbs2Q03350 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Thbs2Q03350 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Thbs2Q03350 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Thbs2Q03350 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Thbs2Q03350 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Thbs2Q03350 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Thbs2Q03350 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Thbs2Q03350 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Thbs2Q03350 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Thbs2Q03350 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Thbs2Q03350 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Thbs2Q03350 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Thbs2Q03350 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Thbs2Q03350 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Thbs2Q03350 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Thbs2Q03350 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Thbs2Q03350 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Thbs2Q03350 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Thbs2Q03350 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Thbs2Q03350 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Thbs2Q03350 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Thbs2Q03350 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Thbs2Q03350 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Thbs2Q03350 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Thbs2Q03350 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Thbs2Q03350 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Thbs2Q03350 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Thbs2Q03350 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Thbs2Q03350 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Thbs2Q03350 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Thbs2Q03350 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Thbs2Q03350 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Thbs2Q03350 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Thbs2Q03350 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Thbs2Q03350 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Thbs2Q03350 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Thbs2Q03350 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Thbs2Q03350 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Thbs2Q03350 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Thbs2Q03350 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Thbs2Q03350 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Thbs2Q03350 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Thbs2Q03350 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Thbs2Q03350 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Thbs2Q03350 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Thbs2Q03350 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Thbs2Q03350 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Thbs2Q03350 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms