Protein–RNA interactions for Protein: P78347

GTF2I, General transcription factor II-I, humanhuman

Predictions only

Length 998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IP78347 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GTF2IP78347 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GTF2IP78347 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GTF2IP78347 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GTF2IP78347 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GTF2IP78347 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GTF2IP78347 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
GTF2IP78347 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GTF2IP78347 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GTF2IP78347 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GTF2IP78347 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GTF2IP78347 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GTF2IP78347 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GTF2IP78347 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GTF2IP78347 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GTF2IP78347 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GTF2IP78347 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GTF2IP78347 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GTF2IP78347 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GTF2IP78347 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GTF2IP78347 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GTF2IP78347 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GTF2IP78347 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GTF2IP78347 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GTF2IP78347 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GTF2IP78347 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
GTF2IP78347 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GTF2IP78347 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GTF2IP78347 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
GTF2IP78347 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GTF2IP78347 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GTF2IP78347 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GTF2IP78347 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GTF2IP78347 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GTF2IP78347 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GTF2IP78347 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GTF2IP78347 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GTF2IP78347 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GTF2IP78347 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GTF2IP78347 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GTF2IP78347 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GTF2IP78347 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GTF2IP78347 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GTF2IP78347 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GTF2IP78347 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GTF2IP78347 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GTF2IP78347 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GTF2IP78347 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GTF2IP78347 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GTF2IP78347 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
GTF2IP78347 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GTF2IP78347 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
GTF2IP78347 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GTF2IP78347 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GTF2IP78347 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GTF2IP78347 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GTF2IP78347 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GTF2IP78347 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GTF2IP78347 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GTF2IP78347 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GTF2IP78347 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GTF2IP78347 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GTF2IP78347 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GTF2IP78347 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
GTF2IP78347 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GTF2IP78347 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GTF2IP78347 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
GTF2IP78347 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GTF2IP78347 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GTF2IP78347 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GTF2IP78347 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GTF2IP78347 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GTF2IP78347 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GTF2IP78347 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GTF2IP78347 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GTF2IP78347 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GTF2IP78347 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GTF2IP78347 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GTF2IP78347 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GTF2IP78347 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GTF2IP78347 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GTF2IP78347 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GTF2IP78347 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GTF2IP78347 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GTF2IP78347 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GTF2IP78347 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GTF2IP78347 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GTF2IP78347 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GTF2IP78347 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GTF2IP78347 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GTF2IP78347 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GTF2IP78347 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
GTF2IP78347 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
GTF2IP78347 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GTF2IP78347 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
GTF2IP78347 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
GTF2IP78347 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GTF2IP78347 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GTF2IP78347 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GTF2IP78347 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms